New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3998036 | 47 (0.870) | 5 (0.090) | 5/258 | NT | 9.0% | coding (54/2163 nt) | uvrD | ssDNA translocase and dsDNA helicase ‑ DNA helicase II |
? | NC_000913 | = 3998077 | 55 (1.040) | coding (95/2163 nt) | uvrD | ssDNA translocase and dsDNA helicase ‑ DNA helicase II |
TATAATCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAA > NC_000913/3997895‑3998177 | tctactCAGCGAATCTCTATATATTCCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCATCCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAGCAGCGCGAAGCGGTgg < 2:657201/138‑1 (MQ=255) aGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGTCAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGcc > 2:504537/1‑143 (MQ=255) aTCTGTGTCTATACCCGGCTCTTTGGCGGAGGGTGTTGCGCTTCTCCGCTCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACgca < 2:283680/143‑1 (MQ=255) aTCTGTATATTGACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTCTTGTTCCGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCTGTGGCCGCGCCACgca < 1:860630/143‑1 (MQ=255) tatatataCCCATCTTTTGGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAAc < 2:155590/143‑1 (MQ=255) tatatataCCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAAc < 1:903017/143‑1 (MQ=255) taCCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTg < 2:485557/143‑1 (MQ=255) tttttGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTggc < 2:612349/143‑1 (MQ=255) tttGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGgccgcgccacgcagcaccagaaggttgctgcgtg < 1:774168‑M1/143‑35 (MQ=255) gttGGCCGAGGGCGTTGCGCCTCTCCGCCCAGCCTATCTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTggcgg < 2:615133/142‑1 (MQ=255) gCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGcccgcgcccgccagcaccagaaggttgctgcgtggcgc < 1:365069‑M1/143‑39 (MQ=255) cGGAGGGCGTCGGGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGgccgcgcccgccagcaccagaaggttgctgcgtggcgcg < 1:346166‑M1/143‑40 (MQ=255) ggAGGGCGTGGCGCTTCTCCGCCCCACCTATTTTTACGCTGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGgcgggcgcgg < 2:27501/143‑1 (MQ=255) gAGGGCGTTGCGCTTCCCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGcccgcgcccgccagcaccagaaggttgctgcgtggcgcggc < 2:880366‑M1/143‑42 (MQ=255) ggCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGcccgcgcccgccagcaccagaaggttgctgcgtggcgcggccac < 2:647712‑M1/143‑45 (MQ=255) cGTTGCGCTTCTCCGCTCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCGTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTg < 1:727206/143‑1 (MQ=255) cGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGCGCCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTg < 1:339332/143‑1 (MQ=255) cgcgcTTCGCCGCCCAATCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGGCGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTa < 2:886629/142‑1 (MQ=255) ctctcCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTGTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGAcg < 1:985950/142‑1 (MQ=255) tcCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGAc > 2:112878/1‑139 (MQ=255) tcCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGAc < 1:112878/139‑1 (MQ=255) cGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGTTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGt > 1:449341/1‑143 (MQ=255) cAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTg < 1:1050649/143‑1 (MQ=255) cAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACCCGCGGAccg > 2:209839/1‑141 (MQ=255) cAACCTAGTTCTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTg < 2:523692/143‑1 (MQ=255) aCCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGt < 1:834910/143‑1 (MQ=255) cTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGCAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGc > 1:966763/1‑143 (MQ=255) gaCGCGGCGGGGCCAATGGACGTGTCGTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCCCGCAGCAACCTGCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTAt < 2:790688/142‑1 (MQ=255) gcggcgGTGCCAATGGACGTTTCATACCTGCTCGACAGCCTTAATGACCAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCAGGCCGTGGTAAGACACGAGTACTGGCGCATCGAATCGc > 2:49323/1‑143 (MQ=255) gcggTGCGAACGGACGTTGCCTACCTGCTCGACGGCCTGAATGACAAACAGCGCGGAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTg < 2:493203/143‑1 (MQ=255) gcggTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTg < 1:774820/143‑1 (MQ=255) gCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTtga < 1:964758/143‑1 (MQ=255) gcTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGTCAACCAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGaaaa < 2:311590/142‑1 (MQ=255) ttACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGGGTGGAAAACt > 1:751442/1‑143 (MQ=255) cTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTc > 1:104577/1‑143 (MQ=255) cTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTc > 2:243484/1‑143 (MQ=255) cTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGACCGCGCCACGCACCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACACGCGTACTGGTGCATCGGATCGCCTCGTTGATAAGCGTGGAAAACCGCtt > 2:25717/1‑142 (MQ=255) tGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCg > 1:759777/1‑143 (MQ=255) tGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAACAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCg > 1:446758/1‑143 (MQ=255) gcccGACAGCCTTAATGACAACCAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGc < 2:357642/140‑1 (MQ=255) gCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGACCCGTTTGTCGCGCGACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGGGCGTGGAACACTGCTctc > 1:448279/1‑141 (MQ=255) gACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGCTGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATa > 1:730783/1‑143 (MQ=255) aCAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGACACGCAGCAACCTTCTGGGGCTGGCGGTCGCGGGCGGTGGTACGACGCGCGTACTGGTGCAACGTAGCGCCAGGGACGTCACCGGGGAAAACTGCTCGCCCTAc > 2:15664/1‑143 (MQ=255) tgctttAATGACAAAGAGCGCGTAGCGGTTGCCGCGCCATGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCTTACTGGTGCATCGTATCGCCGTGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTc < 2:62526/139‑1 (MQ=255) tAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGGTGATGAGAGTGGAAAAATGCTCGCCAGAccccagta > 2:625006/1‑136 (MQ=255) tGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGGACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGGTTATgg > 1:836208/1‑143 (MQ=255) gACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGCTGATGAGCGTGCAAACCTGCTCGCGATCCTCGGTAATGGc > 1:352348/1‑143 (MQ=255) ccAAACATCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCGACCTTCGGGTGCTGGGGGGCGGGGGCAGTGGTGAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCg < 2:715580/142‑1 (MQ=255) cAAACAGCGCGGAGCGGGGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCgg < 2:50699/143‑1 (MQ=255) aaCAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCAGACCCGCGCACGGCGGTg > 2:115739/1‑143 (MQ=255) ccgcgcGAAGCGGGCGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGGGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGAc < 2:425113/141‑1 (MQ=255) cgcgAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGtt > 1:156872/1‑143 (MQ=255) cgcgAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGtt < 1:127197/143‑1 (MQ=255) gTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGcaccgcttcgcgctgtttgtcattaaggctgtcgagcaggtaagaaacgtccattggcaccgccgcgtaaaaataggttgggcggagaagcgcaacgcc < 2:647712‑M2/143‑100 (MQ=255) gTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACcaacaa > 1:961318/1‑143 (MQ=255) tGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACaaa < 1:836679/143‑1 (MQ=255) tGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCGGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACaaa < 1:813899/143‑1 (MQ=255) | TATAATCAGCAAATCTGTATATATACCCAGCTTTTTGGCGGAGGGCGTTGCGCTTCTCCGCCCAACCTATTTTTACGCGGCGGTGCCAATGGACGTTTCTTACCTGCTCGACAGCCTTAATGACAAACAGCGCGAAGCGGTGGCCGCGCCACGCAGCAACCTTCTGGTGCTGGCGGGCGCGGGCAGTGGTAAGACGCGCGTACTGGTGCATCGTATCGCCTGGTTGATGAGCGTGGAAAACTGCTCGCCATACTCGATTATGGCGGTGACGTTTACCAACAAA > NC_000913/3997895‑3998177 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |