New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4513647 | 49 (0.910) | 5 (0.100) | 5/254 | NT | 9.2% | coding (662/903 nt) | fecB | ferric citrate ABC transporter periplasmic binding protein |
? | NC_000913 | = 4513662 | 51 (0.980) | coding (647/903 nt) | fecB | ferric citrate ABC transporter periplasmic binding protein |
CCTGCTGCTTCTGCGCGGCGGTTAACATCTGCCAGAGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCTTTGGGAAGCTGGCT > NC_000913/4513522‑4513804 | ccTGCTCCTTCTTCGCGGCGGTTAACATCTGTCAGAGCGGAGCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCAtg > 2:778897‑M2/1‑141 (MQ=255) gcggcgGTTAACATCTGCCAGAGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCGCTTCTCGATCGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGAGCGCAAGCAGGTGCTCCAGGCGGGTGGACGGCAGGGACGCGCGCGCCAt > 2:88523/1‑143 (MQ=255) ggcggTTAACATCTGCCAGAGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCAAGCAGTCGCCACAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACGCGGCGTCg > 1:217153/1‑143 (MQ=255) cggTTAACATCTGCCCGAGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACGATTCTCTCGTCGCGATAGCGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGTCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCa < 1:1010382/143‑1 (MQ=255) cggTTAACATCTGCCAGGGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCa < 2:1054580/143‑1 (MQ=255) cggCTAACCTCTGCCAGAGCGGAGCCTGTTGGCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAGCCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCa < 1:904814/143‑1 (MQ=255) ggTTAACATCTGCCAGAGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTATTAGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGATCCAGGCCGATGCACGGCACGGGCGCACCCGCCAACCCAg > 2:189363/1‑143 (MQ=255) tAACATCTGCCAGAGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCACCGCCGCgg > 2:243505/1‑143 (MQ=255) cATCTGCCAGCCCGCATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCCGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGTCGCACCCGCCATCGCAGCGGGaa < 1:821381/143‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGTGTGGTCCTCGTTGCCAGCGTTTCACAAGGCTCTCTTCGCGATCGTGGGCGACCGGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAAc < 2:604447/142‑1 (MQ=255) tGCCAGAGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCACCCAGCAGCCAGGCAGGATTGCCCGCCAGCAGTTGCTCCCGGCCGATGGACCGCATGGCCGCACCCGCCGCCGCCGCGGGAACGtt > 2:281279/1‑143 (MQ=255) agagCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTGCAGc > 2:168298/1‑143 (MQ=255) agCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACGATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTGGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGccc < 1:382923/143‑1 (MQ=255) cgtgttgCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTGCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCagagag < 1:72418/141‑1 (MQ=255) ttgttgCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCACCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAgg > 2:479019/1‑143 (MQ=255) tgttgCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGCTAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGCTCGACGGCATGCACGCACCCGCCATCGCAGCGGCGACGTTCAGCCCCCCAGAGGc > 1:903940/1‑143 (MQ=255) tgttgCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGCGAGGc > 1:298182/1‑143 (MQ=255) ttgCCAGCGTTTAACACTGCTCTCTCCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCa < 1:253332/143‑1 (MQ=255) cAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCAc > 1:758824/1‑143 (MQ=255) gCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGCCCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGCTGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCCGCCCCCGACCGGACAgcgcgc > 1:262597/1‑143 (MQ=255) ttAACAGCGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCATGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGcc < 2:274700/143‑1 (MQ=255) gtAACAATGCTCTCTGCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGCCCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCCCCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGcc < 1:982309/142‑1 (MQ=255) aaCAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCgg > 2:848082/1‑143 (MQ=255) aaCAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATCGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGCGTGTACAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGccgccgc > 2:789661/1‑142 (MQ=255) cAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGGGAGGCCCGCACGCTTCCGGTc > 1:77132/1‑143 (MQ=255) cAACGCTCCCTGCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTc < 1:502277/143‑1 (MQ=255) aaTGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTcc < 2:435175/143‑1 (MQ=255) tctctTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCCGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGtc > 1:27514/1‑143 (MQ=255) ctcggcgcgCTAGTGGGCACCCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGtct < 2:481751/138‑1 (MQ=255) ttCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCt < 1:1012309/143‑1 (MQ=255) ttCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCt < 1:972137/143‑1 (MQ=255) ttCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCAGGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCt < 2:795987/143‑1 (MQ=255) aTAGGGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGAGTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTAt < 2:856222/143‑1 (MQ=255) tAGTCGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATg < 1:567283/143‑1 (MQ=255) gTGGGCCACCAGCAGCCAGGCAGGAGTGCCCGCCCGCGGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACTCACCTGCCATCGCAGCGGGAGCGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCa < 2:316242/143‑1 (MQ=255) aaCCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTAGATACAGACCGAGGTAGGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCACAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGGTGa > 1:292995/1‑143 (MQ=255) aCCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGaa < 1:672317/143‑1 (MQ=255) cagcCAGGCCGCATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCTGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCt < 2:191847/143‑1 (MQ=255) cagcCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCt > 1:604741/1‑143 (MQ=255) gcCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGTACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGCGTATGCAGGTTGAATTGCTGt > 1:550881/1‑143 (MQ=255) gcCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCCGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGt > 1:996093/1‑143 (MQ=255) ccAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCTCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCACAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGtt > 2:523947/1‑143 (MQ=255) ggcaggATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTCGAATTGCTGTTcgc > 1:911853/1‑143 (MQ=255) ggATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGCCGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGa < 2:836663/143‑1 (MQ=255) ttGACCGCCAGCCGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGAtgt < 1:923152/143‑1 (MQ=255) ggggccgcccgcAGGTGCCCCACGCCGATGGACGGCATGGACGCCCCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGAtgt < 2:904175/139‑1 (MQ=255) ccAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCAtggacgcaactgctggcggtcaatcctgcctggctgctggttgcccactatcgcgaagagagcattgttaaacgctggcaacaagatccgctctggcagatgttaaccgccgc < 2:708381‑M2/143‑114 (MQ=255) gCTCCAGGCCGATGGACGGCAtggagcaactgctggcggtcaatcctgcctggctgctggttgcc < 1:658959‑M2/65‑45 (MQ=255) gCTCCAGGCCGATGGACGGCAtggagcaactgctggcggtcaatcctgcctggctgctggttgcc > 2:658959‑M2/1‑21 (MQ=255) tCCAGGCCGATGGATGGCAtggacgcaactgctggcggtcaatcctgcctggctgctggttgcccaatatcgcgaagagagccatgttaaacgctggcaacaaaatccgctctggccgatgttaaccaccgcgcagaggcagc < 2:914991‑M2/143‑125 (MQ=255) cAGGCCGATGGACGGCAtggagcaactgctggcggtcaatcctgcctggctgctggttgcccactatcgcgaagagagcattgttaaacgcagacaacgagatgcgctctggcagacgctaatcgtcgcgcagaagcagcagg < 1:391239‑M2/143‑127 (MQ=255) gCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCtt > 1:431135/1‑143 (MQ=255) gCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCtt < 1:848082/143‑1 (MQ=255) cGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAGAGGCCACGCGTGTCCCTTTg > 2:797930/1‑143 (MQ=255) cGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGGTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCTCTg > 2:261182/1‑143 (MQ=255) gACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGCATTGCAGTCCGCGAGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCTTTGGGaac > 2:585050/1‑142 (MQ=255) gACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCTTTGGGAAg < 2:27514/143‑1 (MQ=255) cGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCTTTGGGAAgct > 2:874880/1‑143 (MQ=255) gCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCTTTGGGAAgctgg < 1:479019/143‑1 (MQ=255) aTGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAACGGCCACGCGTGTCCCTTTGGGAAgctggct > 2:995261/1‑143 (MQ=255) | CCTGCTGCTTCTGCGCGGCGGTTAACATCTGCCAGAGCGGATCTTGTTGCCAGCGTTTAACAATGCTCTCTTCGCGATAGTGGGCAACCAGCAGCCAGGCAGGATTGACCGCCAGCAGTTGCTCCAGGCCGATGGACGGCATGGACGCACCCGCCATCGCAGCGGGAACGTTCAGCCCCAGAGAGGCCAGCACGCTGCCGGTCCAGGTCTCCTGAGTATGCAGGTTGAATTGCTGTTCGCGTGATGTGCCAAAGGCCACGCGTGTCCCTTTGGGAAGCTGGCT > NC_000913/4513522‑4513804 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |