| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 227039 | 36 (0.640) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 8.3% | noncoding (1281/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | NC_000913 | = 227046 | 32 (0.590) | noncoding (1288/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
GCTAAACCATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGGAAACAGGTTAATATTCCTGTACTTGGTGTTACTGCGAAGGG > NC_000913/226897‑227181 | gttAAACCATGCACTGAGGCTGCGGCAGCGGCTCTTAGGCGTTGTTGGGTAGGGGAGGGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTCCTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACAT‑AGTAACGATAAAGCGGGt < 1:631219/141‑1 (MQ=11) tAAACCATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGGTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGcg > 1:106913‑M1/1‑141 (MQ=255) ccATGCACCGAAGCGGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGaaaa < 1:725732/143‑1 (MQ=38) aTGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGc < 1:5919‑M2/143‑2 (MQ=255) aTGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGAAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGAGAAAAGc < 2:294570‑M2/143‑2 (MQ=255) cACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAGGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGcgcg < 1:386781‑M2/143‑5 (MQ=255) aCCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTCAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATACGGCGGGGGAAGAGccagc < 2:807304‑M2/143‑6 (MQ=255) gAAGCTGCGGCAGCGACGCGTATGCGTGGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGcttttcacccgcttt < 1:824999‑M1/143‑16 (MQ=255) aaGCTGCGGCAGCCACGCTTATTCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGc < 1:111267/143‑1 (MQ=255) agttGCGGCGGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGTAAAGCCCGCTCGcc < 2:997436/140‑1 (MQ=255) accggcgcCACCGACGCTTATGCTTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTATGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGcc < 2:703637/139‑1 (MQ=11) aGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGCTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGACTGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGcttttcacccgctttat < 2:885811‑M1/143‑18 (MQ=255) gtggCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGaa < 1:400855/141‑1 (MQ=38) cGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAg > 2:627422/1‑143 (MQ=37) cGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTGCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAg > 1:1053136/1‑143 (MQ=38) cAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGAcc < 1:913011/143‑1 (MQ=39) gCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGAGAAAGCGGGTGGAAAGCGCGCTCGCCGGAAGACCaa > 2:972459/1‑143 (MQ=255) gCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGACGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGCGAAAAGCCCGCTCGCCGGCAGACCAAGGGtt > 1:733318/1‑143 (MQ=255) gCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAggggt > 1:381668/1‑141 (MQ=37) cTTATGCGTTGTGGGCGCGGGGGGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCCGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTc < 2:267248/143‑1 (MQ=11) tATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACTATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCt < 1:867304/143‑1 (MQ=37) tATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCt < 2:185417/143‑1 (MQ=37) caTGCGTTGTCGGCTACGGGCGCGTTCTGTAAGCCGGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGAAATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCt < 1:90923/142‑1 (MQ=11) tGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCATGt > 1:343691/1‑143 (MQ=37) gggttgttggTTGGGGGTGCGTTGTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGcttttcacccgctttatcgttacttatgtcagcattcg < 2:101049‑M1/141‑39 (MQ=255) gCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCtctc > 1:553323/1‑143 (MQ=37) cgttgGGTAGGGGAGCCTTCTGTCAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGGATCAGAAGCGCTACTGCGGACATAAGTTACGATAAAGCGGGTGCTAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAAc < 2:603013/142‑1 (MQ=11) tgGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGtt < 2:895621/143‑1 (MQ=35) ggTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGCGTACTGTGCGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGATGAAATAAGAAACGAAAAAGCGGGCAAAAAGACCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTaa > 1:690997/1‑143 (MQ=11) gggAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCggg > 1:114689/1‑143 (MQ=35) gggAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCggg > 1:517642/1‑143 (MQ=35) ggAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGCGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCACCAGCACCGCTCCCACGTTAATCcggg > 2:1010283/1‑143 (MQ=11) gCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGCGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAg < 1:133019/143‑1 (MQ=25) tgTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACAGAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAgg > 1:157641/2‑143 (MQ=25) cGTTCTGCAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAgg < 1:394193/143‑1 (MQ=25) tgcTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGt < 1:59342/141‑1 (MQ=21) aaGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCg < 2:1053136/143‑1 (MQ=34) gcTGGGAAGGTGTCCTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGAcc < 2:51878/142‑1 (MQ=17) gtgAATGTGTACTGTTAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCt < 2:40423/143‑1 (MQ=21) tgtACTTGGAGGTATGCTAGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATGAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCACCGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGTCGa < 2:964357/143‑1 (MQ=11) tgtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGa > 1:1044401/1‑143 (MQ=34) tgtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGa < 1:934195/143‑1 (MQ=35) tgtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCACGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGa > 1:927157/1‑143 (MQ=21) aGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAg > 2:27197/1‑143 (MQ=32) gTATGGTGGAGGTGCCAGAAGTGCGAATGCGGGCATAAGTAACGATACAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGGAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGc < 2:665831/143‑1 (MQ=11) cGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGcccgctttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacacaacgcacccccaaccaacaaccc < 2:101049‑M2/143‑106 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGcccgctttatcgttacttatgtcagcagtcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacagaacgctcccctacccaacagcgcataagcgtcgctgccgcagct < 2:885811‑M2/143‑127 (MQ=255) aaaGCGGGTGAAAAGcccgctttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacagaacgctcccctacccaaccacgcatacgcgtcgctgccgcagcttc < 1:824999‑M2/143‑129 (MQ=255) gctggctcttcccccgccgtatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggctgacagaacgctcccctacccaacaacgcataagcgtcgctgccgcagcttcggt < 2:807304‑M1/140‑139 (MQ=255) cgcgcttttcacccgctttatcgttacttatgtcagcattcgcacctctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacagaacgctcccctacccaacaacgcataagcgtcgctgccgcagcttcggtg < 1:386781‑M1/140‑140 (MQ=255) gcttttctcccgctttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacagaacgctccccttcccaacaacgcataagcgtcgctgccgcagcttcggtgcat < 2:294570‑M1/143‑143 (MQ=255) gcttttcacccgctttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacagaacgctcccctacccaacaacgcataagcgtcgctgccgcagcttcggtgcat < 1:5919‑M1/143‑143 (MQ=255) | GCTAAACCATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGGAAACAGGTTAATATTCCTGTACTTGGTGTTACTGCGAAGGG > NC_000913/226897‑227181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |