New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2304842 = | NA (NA) | 4 (0.070) | 3/250 | NT | NA | noncoding (32/36 nt) | other | REP161h |
? | NC_000913 | = 2347239 | NA (NA) | noncoding (2/36 nt) | other | REP164b |
GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGC > NC_000913/2304706‑2304936 | gACGCTGGCGCGTCTTATCAGGACTACACCGCTGTGAAGTGCTACACCCCGTAAGTTGGATAAGGCGGCTACGCCGCAACCGACATCTAACGTCCGAGACGGTTGGCTGATGGGACGCTCGCGCGACATACCAGGCCAACAcc > 2:28619/1‑143 (MQ=11) gggCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGGGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtgt < 1:784555/142‑1 (MQ=255) tCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCGTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTCCACCCCTGCGACGTGCCCCAc > 1:555417/1‑143 (MQ=14) aGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCCTACACCGCTGTGACGCGCTCCAccc > 2:305596/1‑143 (MQ=255) tgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTGCACCGCTGGGGACTGCCCCACCCCGTAGGTCGGATCAg > 1:409568/1‑143 (MQ=14) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGGTCCACCCCGTACGTCGGATAAGGc > 2:107365/1‑143 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCCCTGTGGAGTGCGCCACCCCCTAGGTCGGCTAAGGc > 1:184392/1‑143 (MQ=14) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGAGAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCTCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg < 1:470329/143‑1 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:639114/143‑1 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGTCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGGAGTGCTCCACCCCGTAGCTCGGATAAGGCGGGTAcgc > 1:238758/1‑143 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAGGTGGCAAACCCCGTGGGGGGGAGAAGACGGtggccg > 2:122390/1‑138 (MQ=14) aCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGGAGTGCTCCACCCCCTAGGTCGGCTCCGGCGGTCAcgcc > 1:165996/1‑143 (MQ=14) cttAGTTTGGATAGTGCGTTTACGCCGCACCCGACATCCAACGGCCGACCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAt < 1:439055/141‑1 (MQ=11) tAGGTCGCATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATcc < 1:193341/143‑1 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGACGGGTACGCCGCATCCGAc > 1:894704/1‑143 (MQ=255) ttGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACa > 1:117899/1‑143 (MQ=40) gCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGCGACGTGCTCCACCCCGTAGGGCGGATAAGGCGGGTACGCCGCATCCGACATCCAACGcc > 2:813300/1‑143 (MQ=11) ctcgccccTTCCGACAGCCATCGTCCGTGCCGGTTGCCTGGTGCGCCGCTGGCGCGTCTTATCAGGTCGACACCGCTGTGAAGTGCTCCGCCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGc < 2:592761/141‑1 (MQ=11) gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCgg < 1:859273/143‑1 (MQ=32) gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCATATCAGGCCGACACCGCTGTGAAGTGCTACACCCCGTAGGTCCGATCATGCGGTTACGGCGCATACGACATCCAACGCCCAAGGCgg > 2:32059/1‑143 (MQ=11) cGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCa < 1:190470/79‑1 (MQ=34) cGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGCCATCTAACGCCCCAGCCGGTTCCCTGa > 1:813297/1‑143 (MQ=12) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCCTCCACCGCTCTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATCAGGCGGTCACGCCGCATCCACCATCTAACGCCCAAGCCGGGTGCCCGAt > 2:22996/1‑143 (MQ=11) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTACGTCGGATAAGGCCGTTACGCCCCACCCCACATCTCACGCCCCACCCCGCTGCCTCAt > 2:35961/1‑143 (MQ=11) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGCAGGTCGGATAAGGCGGATACGCCGCACCCCACCTCTAACCCCCAAGCCGGCCGCCCGACGCGCCg > 2:160863/1‑143 (MQ=11) aaCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGGCATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGc > 1:35082/1‑143 (MQ=17) | GACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGC > NC_000913/2304706‑2304936 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |