New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2304842 = | NA (NA) | 4 (0.070) | 3/250 | NT | NA | noncoding (32/36 nt) | other | REP161h |
? | NC_000913 | = 2347239 | NA (NA) | noncoding (2/36 nt) | other | REP164b |
CTGGTGCCGTCAATCCAGGACGATGGCTGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTAAACTCCCAACAGGACACA > NC_000913/2347097‑2347380 | cTGGTGCCGTCAATCCAGGACGATGGCTGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGCCGCGCCAGCGTCGCAGCAGGC < 2:201715‑M2/143‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGTCAATCCAGGACGATGGCTGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCCGCGTCGCATCAGGC < 2:737216‑M2/143‑1 (MQ=255) gCCGTCAATCCAGGACGAAGGCTGCGAAGGCGGGGTGTGTCCTCACCAATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCgg < 1:801483/143‑1 (MQ=18) ccGTCAATCCAGGACGATGGCTGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCggg > 1:586202/1‑143 (MQ=255) cAATCCAGGACGATGGCTGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGAGATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGcc < 1:170293/143‑1 (MQ=255) cAGGACGATGGCTGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATg < 2:798287/143‑1 (MQ=255) ggACGATGGCTGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCa > 1:976611/1‑143 (MQ=255) gCTGCGATGGCGTCACAGTTAAGTTCGGATCTTGATACGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACTCGCCACCGTCTCAAAAGGTTCCGGGTGCTGAATGCAGTGTGAAc < 2:968124/143‑1 (MQ=12) tGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGCTATTGAGATGCCCGATGCGCCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCCCCCGCGTCACATCCCGCGCCCGCTGCCCCCTGCAGCGCGacccc > 2:301232/1‑139 (MQ=18) cggcgCATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTGGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCg < 1:321029/143‑1 (MQ=255) gcgcATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGc < 2:275423/143‑1 (MQ=255) gcgcATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGAAAACGCCTTATGCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGc > 1:759146/1‑143 (MQ=255) cacgTAAGATCCTATCTTCCGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTa < 1:390047/140‑1 (MQ=25) cATGTAAGATCGGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTa < 1:552711/143‑1 (MQ=255) gTAAGAGCGGATAGTGAGAGGCCGGGTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACgg < 2:27236/143‑1 (MQ=25) tAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGc > 1:1077090/1‑143 (MQ=255) gaggtGATATGGAGAGGCGGGACGCGGCGTAAACGCGTTATCCGGCCTACGGCTCGGGTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCg < 1:298243/139‑1 (MQ=25) cTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGAGCCAGCGTCCCAGCAGGCTCCGGGTTCCGGGAGCAGCGTGCACCGCGTATCCAGCCGGCCGCTCggca > 2:743838/1‑141 (MQ=18) tagtatTGAGATGCCGGATGCGGCGGAAACGCCTTATCCGGCCGACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGAtt < 2:211266/140‑1 (MQ=255) tGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGAtt < 1:424212/143‑1 (MQ=255) tatTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAGGACGCGCCAGCGGCGCATCAGGCTCCCGGTGCCGGATGCAGCGGGAACGCCGTATCCTGCCTCCGGCCCGGGTTTgg > 1:593703/1‑142 (MQ=21) ttGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTCCGGCTCGGAGTTGTAg > 2:1095031/1‑143 (MQ=255) gtGAGAGGCCTCAGGCGGCGTACGCGCCGTGTCGGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGGCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAg < 2:529547/142‑1 (MQ=25) tGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAgg < 1:905404/143‑1 (MQ=255) tGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAgg < 1:228594/143‑1 (MQ=255) gagggcGGAGGCGGCGTAGATGCTTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTGGTAGGGCTGAGAAGGCGCGCCAGCGGCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCt < 2:747240/138‑1 (MQ=25) gagggcGGAGGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCt < 2:87392/138‑1 (MQ=255) ccGGGTGGGGCGGAAAGGCCTGATCGGGCCTACGGCTCGGTGTGTAGGCCTGAGAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATa < 2:362006/143‑1 (MQ=25) aTGCGGCGTAAACGCCTTAGCCGGCCGACGGCTCGGTTTGGAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGAc < 1:173641/143‑1 (MQ=255) ggcgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGGCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATGAGACgcgc > 1:228387/1‑143 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGcc > 1:529391/1‑143 (MQ=255) cgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGCTGCAGGGTGCACGCCGTATCCGGCCTACGGCTCGGGTTTGTCGGGCTGATAAGACGCGCCa > 1:975214/1‑143 (MQ=25) tAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTCCGGCTCGGATTTGTACGCCTGATAAACCGCGcctac > 2:758019/1‑140 (MQ=37) cTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCAt > 1:588147/1‑143 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAg > 1:1001152/1‑143 (MQ=255) tCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAgg < 1:435393/143‑1 (MQ=255) ggCCTACGGCTCGGATTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGcac < 1:489306/143‑1 (MQ=255) gtGTAGGCCTGAGAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTaaa < 2:320547/142‑1 (MQ=255) tAGGCCGGATAGGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGCCGGGGGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTAGCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTaaatgc < 2:13392/143‑4 (MQ=25) aGGCCGGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGc < 2:714497/143‑1 (MQ=255) ggCCTGACAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGCTGCCGGATGCAGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGCGCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGcc < 2:136611/143‑1 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccgacatctaacgcccaagccggttgc < 1:466889‑M2/114‑84 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccgacatctaacgcccaagccggttgc > 2:466889‑M2/1‑31 (MQ=255) aTAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCCGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATcc > 1:411364/1‑143 (MQ=255) aGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGc > 1:259163/1‑143 (MQ=255) aCGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCAt < 2:453347/143‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCCTCAGGCACCAGATGCGGCGCAAAATTCCTTATCCGCCATTa > 2:847691/1‑143 (MQ=25) gcCCGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTaaa < 2:759146/143‑1 (MQ=255) cggcgcCGGATCGGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCGTAGCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGCTAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTAAACt < 2:216308/141‑1 (MQ=25) cAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCAGTAAACt > 1:403270/1‑143 (MQ=255) cAGAGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTAAACt < 2:161560/143‑1 (MQ=255) cgcGTCACATCAGGGctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccgacatctaacgcccaagccggttgcctgatgcgacgctggcgcgtcttatcaggcctacaccgctgtgaa > 1:656907‑M2/2‑15 (MQ=255) gCGTCTCCTCACGCctacaccgctgtcaggtgctccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccgacatctaacgcccaagccggttgaagaatcgggcgcggtcgcgtcttatcaggcctacaccgctgtgaag > 2:238758‑M2/1‑14 (MQ=255) aTCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTAAACTCCCAACAgg < 2:846298/143‑1 (MQ=255) tccggCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGTCTCAGCCGTCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTAAACTCCCAACAGGa < 2:228387/140‑1 (MQ=37) tCAGGCctacaccgctgtgaagtgttccaccccgtaggtcggataaggcggttacgccgcatccgacatctaacgcccaagccggttgcctgatgcgacgctggcgcgtattatcctgcctacaccgctgtgacgtgctcccc < 1:461042‑M2/143‑138 (MQ=255) aGGCGCCGGGTGCCGGAGGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTAAACTCCCAACAGGaca < 1:134251/143‑1 (MQ=255) gCctacaccgctgtgaagtgctccaccccgtaggtcggataagg < 1:994854‑M2/44‑43 (MQ=255) gCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTAAACTCCCACCAGGacacc > 1:778291/1‑142 (MQ=255) | CTGGTGCCGTCAATCCAGGACGATGGCTGCGAAAGCGGCGCATGTAAGATCTGATATTGAGATGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCTCCGGGTGCCGGATGCAGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGCTCGGATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCACAGGATGCGGCGTAAAATGCCTTATCCGGCATTAAACTCCCAACAGGACACA > NC_000913/2347097‑2347380 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |