New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1409894 = | 27 (0.810) | 3 (0.090) | 3/252 | NT | 11.0% | coding (384/1374 nt) | dbpA | ATP‑dependent RNA helicase DbpA |
? | NC_000913 | 1409908 = | 23 (0.730) | coding (398/1374 nt) | dbpA | ATP‑dependent RNA helicase DbpA |
GTGAACTGGCGGATCAGGTGGCAGGTGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATGCTGGATATGGGATTTAGCGATGCCATTGATGATGTCATCCGTTTTG > NC_000913/1409752‑1410030 | gTGAACTGGCGGATCAGGTGGCAGGTGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGCTTCGTTGCACCCTCCGCCGCTGCTTCTCGTGGCa > 1:169718/1‑143 (MQ=255) gATCAGGTGGCAGGTGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCg > 1:80943/1‑143 (MQ=255) cgcaaaacggatgacatcatcaatggcatcgctaaatcccatatccagcatgcggtcggcctcatccatcaccagcgtattcaacgcatccagtgataccgtgcctttttgcaggtgatccagcaAACGCCGGGGCGTTTGCt > 1:124613‑M1/126‑143 (MQ=255) tGGCAGGTGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTGTGCtc > 2:100705/1‑142 (MQ=255) tGGCAGGTGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGGTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACGTGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTg > 2:265506/1‑143 (MQ=255) tGGCAGGTGAAGTGCGTCGGCTGGCGCGTGTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTg < 1:129774/143‑1 (MQ=255) ggCAGGTGATTTGCGTCGGCTGGCGTGTTTGCTGCCCAATACCAAAAGTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTgg < 2:345084/143‑1 (MQ=255) ggCAGGTGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTgg < 1:242798/143‑1 (MQ=255) gCAGGTGACTTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGAACCTTGGGCCGCGTAGTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGa < 1:340635/143‑1 (MQ=255) ggTGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGATTGCTGGATCa > 2:590265/1‑143 (MQ=255) tGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCAcc < 1:77699/143‑1 (MQ=255) ttttCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTCGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGTCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGGAAAAAGGCGCGGTATCAc > 1:61050/1‑143 (MQ=255) ttCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTg < 2:80943/143‑1 (MQ=255) aaaaTTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATAc > 1:477002/1‑143 (MQ=255) aaaaTTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATAc > 1:153596/1‑143 (MQ=255) tacgccgtgCGGTGGTGAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCCGTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTga < 1:47247/137‑1 (MQ=255) tgggggcgtCAGCCGTTGGGTCGGCGGGGTGATGCGTTGCAACATGCGCCGCAGACTATCGTGGACGGGACGGAGCGGATGGTAATTGCTCGGTAAAGGGGGACGGTAGCACTGGATGCGGTGAATGCGCTGGTGATGGATGa < 2:469399/136‑1 (MQ=255) atcaccagcgtattcaacgcatccagtgataccgtgcctttttgcaggtgatccagcaAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCa < 1:661239‑M1/38‑1 (MQ=255) atcaccagcgtattcaacgcatccagtgataccgtgcctttttgcaggtgatccagcaAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCa > 2:661239‑M1/59‑96 (MQ=255) cAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCg > 2:371585/1‑143 (MQ=255) aaCCGTTCGGCATGCCGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGc < 1:16104/143‑1 (MQ=255) aCCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGGACGAGTCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGAGCACCTTCAAAAAGGCACGGGAGCACGGTATGCGTTGAATACGCGGGTGATGGAGGAGGCCGACCGCa > 2:322886/1‑143 (MQ=255) cGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATg < 1:443713/143‑1 (MQ=255) gTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATGc > 1:443632/1‑143 (MQ=255) ttCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGCTGAGGCCGACCGCATGCt > 1:204548/1‑143 (MQ=255) gCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATGCTGGATATGGGAt > 2:487766/1‑143 (MQ=255) ttCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATGCTGGATATGGGATTTAGCg > 1:309546/1‑143 (MQ=255) ttGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATGCTGGATATGGGATTTAGCGATGc < 2:531059/143‑1 (MQ=255) ccgcATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATCCGCTGGTGCTGGATGAGGCCGACCGCCTGCTGGATATGGGATTTAGCGATGCCATTGATGgtgt > 2:175866/1‑143 (MQ=255) tattatCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATGCTGGATATGGGATTTAGCGATGCCATTGATGATGTCATcc > 1:314982/1‑143 (MQ=255) cGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATGCTGGATATGGGATTTAGCGATGCCATTGATGATGTCATCCGTTTTg > 1:546463/1‑143 (MQ=255) | GTGAACTGGCGGATCAGGTGGCAGGTGAATTGCGTCGGCTGGCGCGTTTTCTGCCAAATACCAAAATTTTGACGTTGTGCGGTGGTCAACCGTTCGGTATGCAGCGTGATTCGTTGCAACATGCGCCGCATATTATCGTGGCAACGCCGGGGCGTTTGCTGGATCACCTGCAAAAAGGCACGGTATCACTGGATGCGTTGAATACGCTGGTGATGGATGAGGCCGACCGCATGCTGGATATGGGATTTAGCGATGCCATTGATGATGTCATCCGTTTTG > NC_000913/1409752‑1410030 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |