New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3114511 | NA (NA) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | NA | intergenic (‑159/+39) | pppA/yghJ | prepilin peptidase/putative lipoprotein YghJ |
? | NC_000913 | = 3114541 | NA (NA) | noncoding (29/34 nt) | other | REP219c |
TTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGG > NC_000913/3114369‑3114652 | ttgcAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCAt < 1:225303/143‑1 (MQ=255) tGTAACTTGGCGGATGCGGCGTAAACCGCTTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATg < 1:230495‑M1/143‑2 (MQ=255) aaCTTGCTGGATGCGGCGTAACACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATgccg < 2:592869‑M1/143‑5 (MQ=255) tctTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTGCCCCGTCTGTAGGCCCAATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATgccgg < 2:638980‑M1/142‑6 (MQ=255) tGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATgcgg > 1:110990/1‑143 (MQ=255) agATGGGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATgcggc < 1:577504/142‑1 (MQ=255) tGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCGGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTTGGTGGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCCGGCAAATGTGTTACCCCGGTGCGCCTCATTTCCTGACGGATGCGGcgcg > 2:618067/1‑143 (MQ=255) ggcgTAAAACGCCTTATCCGTCATACGCGAGGCGGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTCCCTGCCGGATGCGGCGCGAgc > 2:826086/1‑143 (MQ=255) gcgTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATAGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGGTAAG‑CCGGCGCATCGGGCACACGTGTTAACCCGGTCCGCCTTATTCCACGCCGGCTGCGGAGCGAccg > 2:155063/1‑143 (MQ=255) gcgTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCACAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAgcg > 1:288673/1‑143 (MQ=255) cgTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATACGACAAAAGTAT‑ATTTATAGTTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTCCATGCCGGCGGCGGCGCGAgcga > 1:214212/1‑142 (MQ=255) cgTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGAGAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAgcgc < 1:374214/143‑1 (MQ=255) aaaCGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCCCGAGCGCCTTA < 2:616831‑M2/143‑1 (MQ=255) aaCGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGGAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGCTGCGGCGCGAGCGCGTTAT < 2:480749‑M2/143‑1 (MQ=255) gCCTGATCGGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAGATGATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCG > 1:249923‑M2/1‑143 (MQ=255) tATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATgccggataaggcgctcgcgccgcatccggcat < 1:234080‑M1/143‑33 (MQ=255) tCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATCCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCccac < 1:880079‑M2/143‑5 (MQ=255) tCCGTCCTACGGATGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCCAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATCCGGCGCGAGCGCCTTACCCGGCCtgc > 1:180881/1‑141 (MQ=255) ccGTCCTGCGGGTGTCTGCCCGCGCTAATACTCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACg < 2:5816/143‑1 (MQ=255) cGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACgg < 1:199300/143‑1 (MQ=255) cccTGCGGGTGTCTGCCAGCGGAAATAATCGCGGCGTTCCCCGTGTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGc < 2:129112/142‑1 (MQ=255) ctccGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAGTCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCtt < 1:672077/140‑1 (MQ=255) tACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGCGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTa > 1:225096/1‑143 (MQ=255) aCGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTAc > 1:677701/1‑143 (MQ=255) gggTGTCGGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTc < 1:274144/143‑1 (MQ=255) gtgtCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGCCCAGCTCCG‑ATGGTAGTGCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCgg < 1:213782/143‑1 (MQ=37) cgaccAGCTTAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGa < 2:806036/140‑1 (MQ=255) cAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATc < 2:629840/143‑1 (MQ=255) aaaTAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGTAGACGTCTTATGc > 1:62447/1‑143 (MQ=255) aataatCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTACCCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCt < 2:783215/143‑1 (MQ=255) aataatCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTAGTCGGCAGACCTCTTATGcc > 2:766442/1‑142 (MQ=255) tCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGGGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCGGGCATCTTCTGCTCGGTa > 1:600612/1‑143 (MQ=255) tCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACACCTTATGCTCGGtg > 2:364281/1‑142 (MQ=255) cgcgGCTTGCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTaa < 2:727576/143‑1 (MQ=255) gcgGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATCCGGCGCGCCCGCCTTATCCCGCCCACGGGCTTCCTCTGCAGACGTCCTCTGCTCgctcac > 1:907765/1‑138 (MQ=255) cccGGCTGTAGCCCCGGTGAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTATCCCGGTGCGCCTTATTTCGTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGTCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAAt < 2:713192/143‑1 (MQ=38) cTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGCCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTGATGGttt > 2:848390/1‑143 (MQ=255) tGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTc < 1:489817/143‑1 (MQ=255) tAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTACCCGGCCTACGGGCTTACTCGGAAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTCATGGTTTCCg > 2:502778/1‑143 (MQ=255) ggCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGt < 1:778666/143‑1 (MQ=255) gCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGGGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTc < 2:426442/143‑1 (MQ=255) cccGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTCTTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTCTCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTCATGGTCTCCAGTcc > 2:76844/1‑143 (MQ=39) ccGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATgccggataaggcgctcgcgccgcatccg < 2:97204‑M1/81‑29 (MQ=255) ccGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATgccggataaggcgctcgcgccgcatccg > 1:97204‑M1/1‑53 (MQ=255) aaG‑CAGGCGCACCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCCTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTGCGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTc < 1:566562/143‑1 (MQ=255) aG‑CGGGCGCATCGGGCAAATGTGTTCACCCGGTCCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTcc < 2:543733/143‑1 (MQ=255) g‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTGATGTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCg < 2:571086/143‑1 (MQ=255) cAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCgc > 2:883519/1‑142 (MQ=255) cAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACACCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCGCGTTCCgg > 2:540134/1‑143 (MQ=255) aGGCGCATCGGGCAGATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGt < 2:67492/143‑1 (MQ=255) ggCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTCCCGGtt > 1:73316/1‑143 (MQ=255) gcgcATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGGTTAATGGTTTCCCGCCCCTGCTCCGGtct > 1:919082/1‑141 (MQ=255) aTCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGc > 2:383196/1‑143 (MQ=255) ggCAAATGTGTTCACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCt < 1:493074/89‑1 (MQ=255) ggCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCt > 2:493074/1‑89 (MQ=255) aaaTGTGTTAACCATGTGCGCCGGAGTTCAGGCCGGAGGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACGTGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCTGTCCCTGTTCCTGTTTCGGCAGATCGa < 1:242345/143‑1 (MQ=255) gtgtTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGa < 1:626452/143‑1 (MQ=255) tgtTCACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGTATGCGCCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGAc < 2:893148/143‑1 (MQ=255) gtTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTGCTCGGCAGGCATCTTGTGGTCGGTAACCTGATTAATGGTTTGCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGGAGGTCGGGTGAcg > 1:722529/1‑143 (MQ=38) gtTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGACCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCCTATGCTCGGGAACCTGATTAATAGTTTCCGGTCCCTGCTCCGGCTACGGCAGATCGAgcggcg > 2:648865/1‑138 (MQ=38) ttAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGAcgc > 2:602116/1‑143 (MQ=255) aaCCCGGTGCGCCTTATTTCACGCCGGAGGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGa < 2:40142/143‑1 (MQ=255) ttCGTGCGGGATGGCGCTCGCGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAAGGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGAc < 2:557755/143‑1 (MQ=255) tCATTCCGGATGCGGGTTGAGTGCCTTATCCGGCCTCCTGGCTTACTCGGCTGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTGCGCTCTTGGTGGATCGATAGACTCGAGCGTGTTGTAAGCCGACt < 2:289857/143‑1 (MQ=255) aTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCatgaaataaggcgcaccgggttaacacatttgcccgatgcgcctgcttatcgggcctacagacggggaaagccgcgattatttgcgctggcagacacccgtaggacggata < 1:234080‑M2/143‑112 (MQ=255) aTGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTgg > 1:111609/1‑143 (MQ=255) | TTGTAACTTGCTGGATGCGGCGTAAAACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAG‑CAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGG > NC_000913/3114369‑3114652 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |