New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 998447 | 103 (1.080) | 8 (0.090) | 8/256 | NT | 7.6% | intergenic (+40/‑43) | elfA/elfD | putative laminin‑binding fimbrial subunit/putative fimbrial chaperone ElfD |
? | NC_000913 | = 998451 | 99 (1.110) | intergenic (+44/‑39) | elfA/elfD | putative laminin‑binding fimbrial subunit/putative fimbrial chaperone ElfD |
CATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/998290‑998447 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccctccagAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGATCTCCATC < NC_000913/998451‑998303 CATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAC < 2:794102/150‑1 CATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAC > 1:515826/1‑150 CATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAC > 1:764461/1‑150 ATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACC < 1:193497/150‑1 GTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCC < 2:264197/150‑1 GTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCC > 1:893624/1‑150 TTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCA < 2:54738/150‑1 TGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAG < 1:544749/150‑1 TCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAAAAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAGGGG < 1:1234647/150‑1 AGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAGGGGTA < 2:1600293/150‑1 GACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAGGGGTAC < 2:976242/150‑1 GACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTA < 2:7658/150‑1 AAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAAC < 2:515826/150‑1 ggtGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGATCTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAAT < 2:127851/147‑1 GACATCACGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATAAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAA < 1:540072/150‑1 aGTGAATGCGCTAACAAATTTCCATATAAACAATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTACTACCCCTCCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTG < 1:1075487/149‑1 CCCTCCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGAT < 2:10605/150‑1 CCCTCCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGAT < 1:512833/150‑1 TCCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGATCTC < 1:1477797/150‑1 CCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGATCTCC > 2:1396995/1‑150 CCAGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGATCTCC > 2:518727/1‑150 AGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGATCTCCAT < 2:1125787/150‑1 AGAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGAGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGATCTCCAT > 1:662879/1‑150 GAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGATCTCCATC < 2:1491228/150‑1 CATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/998290‑998447 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccctccagAACACTGGAGGGGTACTAATTAATAAAACAATTAATGAGTTCTATTAATAATAGTTAATATGGAAATTTGTTACCGCATTCACATTACCTGAAGTCGCTTTCCCCGTAGCGATATAATCAACTTTAAAAGTCAACGTCTGATCTCCATC < NC_000913/998451‑998303 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |