| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 998447 | 103 (1.080) | 8 (0.090) | 8/256 | NT | 7.6% | intergenic (+40/‑43) | elfA/elfD | putative laminin‑binding fimbrial subunit/putative fimbrial chaperone ElfD |
| ? | NC_000913 | = 998451 | 99 (1.110) | intergenic (+44/‑39) | elfA/elfD | putative laminin‑binding fimbrial subunit/putative fimbrial chaperone ElfD | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGC > NC_000913/998298‑998596 | gCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAgt > 2:845542/1‑150 (MQ=255) aTGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCTCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTct > 1:662879‑M2/1‑148 (MQ=255) aTGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTct < 2:1125787‑M2/150‑3 (MQ=255) ggAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTctgg > 2:518727‑M2/1‑146 (MQ=255) gagaTCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTctgga < 1:1477797‑M2/150‑6 (MQ=255) aTCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTctggaggg < 1:512833‑M2/150‑9 (MQ=255) tCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAAAAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGaacactggagggg < 1:1234647‑M1/150‑14 (MQ=255) caatcccgcctttacctgccgcccatgcggatgagcagctgagtaatattgccgttaaacttacggtcacaattccctttgttatgcaagttttcataaatagtcactcttaaaaaatatgaatatCCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGat > 2:1609151‑M1/127‑150 (MQ=255) aGACGTTGACTTTTTAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGat < 2:1446752/150‑1 (MQ=255) aGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGaacactggaggggta < 2:1600293‑M1/150‑16 (MQ=255) aGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGat > 2:288644/1‑150 (MQ=255) gACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGaacactggaggggtac < 2:976242‑M1/150‑17 (MQ=255) gACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGAGTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAAGTATTATTAATAGAAGTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCAAGTTTTCTGGAGGGGATATTCata > 1:413813/1‑150 (MQ=255) aCTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCatat > 2:1276135/1‑150 (MQ=255) tttacctgccgcccatgcggatgagcagctgagtaatattgccgttaaacttacggtcacaattccctttgttatgcaagttttcataaatagtcactcttaaaaaatatgaatatCCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATAttt > 1:1123146‑M1/117‑150 (MQ=255) aaaGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGaacactggaggggtactaattaataaaac < 2:515826‑M1/150‑30 (MQ=255) aaaGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTa < 2:541385/150‑1 (MQ=255) aGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAag > 2:628471/1‑150 (MQ=255) aGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAag < 2:1455241/150‑1 (MQ=255) aGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAag < 1:288644/150‑1 (MQ=255) gTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAAGTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCTGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAaga < 2:376682/150‑1 (MQ=255) ttGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAagag < 1:1343196/150‑1 (MQ=255) tGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGt < 1:10605/150‑1 (MQ=255) tGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGt > 1:257542/1‑150 (MQ=255) tGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGt > 2:992288/1‑150 (MQ=255) aTTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGa > 1:971127/1‑150 (MQ=255) ttATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGAc < 1:1276135/150‑1 (MQ=255) tataTCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACt < 1:1491228/150‑1 (MQ=255) gggtACTGGGAAATCGACTTCAGGTAATGTGAATGAGGTTACAAATTTATATATTAACTATTATTAATATAGGTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAGGCGTTGATTTTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTTACTATTTa < 2:615498/147‑1 (MQ=255) cGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTa < 1:260551/150‑1 (MQ=255) gCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTAt < 2:1242439/150‑1 (MQ=255) aCGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGaa > 1:966287/1‑150 (MQ=255) ggtgaaaGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGATCTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaat < 2:127851‑M1/147‑50 (MQ=255) ggggAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGTGGATATTGATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGaaaa < 2:520760/150‑1 (MQ=255) aaaGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTg < 2:1520148/150‑1 (MQ=255) aaaGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTg < 1:1091149/150‑1 (MQ=255) aaGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGaaaa > 2:536162/1‑145 (MQ=255) gACATCACGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATAAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaa < 1:540072‑M1/150‑59 (MQ=255) aCTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAAc < 2:764461/150‑1 (MQ=255) atattgccgttaaacttacggtcacaattccctttgttatgcaagttttcataaatagtcactcttaaaaaatatgaatatCCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACa > 2:1213504‑M1/82‑150 (MQ=255) ttCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACaa < 2:893624/150‑1 (MQ=255) ttCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACaa < 2:1182131/150‑1 (MQ=255) gTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGa < 2:1153316/150‑1 (MQ=255) tAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGaa < 2:1499248/150‑1 (MQ=255) tgtgAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtg < 2:323058/150‑1 (MQ=255) agtgaATGCGCTAACAAATTTCCATATAAACAATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTACTACCCCTCCAGaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttg < 1:1075487‑M1/149‑71 (MQ=255) tgAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtgtg < 1:1652851/150‑1 (MQ=255) tgAATGAGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATACAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAACCATCAAGTGTTCTGGAGGTGATATTCATATTTTTTAAGAGTGAATATTTATGAAAACTTGCATAAAAAAGGGAATtgtt > 2:1305509/1‑149 (MQ=255) aaTGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGAc > 1:1383396/1‑150 (MQ=255) cGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGa < 1:930895/86‑1 (MQ=255) cGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGa > 2:930895/1‑86 (MQ=255) gTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAg < 2:215779/150‑1 (MQ=255) gTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAg < 1:628471/150‑1 (MQ=255) caattccctttgttatgcaagttttcataaatagtcactcttaaaaaatatgaatatCCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa > 2:765817‑M1/58‑150 (MQ=255) cAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa > 1:1137138/1‑150 (MQ=255) cAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa > 1:1186098/1‑150 (MQ=255) aaTTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAAc > 1:159114/1‑150 (MQ=255) ttCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGc < 2:1477797/150‑1 (MQ=255) cATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAat > 1:449561/1‑150 (MQ=255) ttAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTctggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctatttataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacgtgatgtc < 1:540072‑M2/150‑93 (MQ=255) tatgcaagttttcataaatagtcactcttaaaaaatatgaatatCCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTAc > 2:945814‑M1/45‑150 (MQ=255) tatgcaagttttcataaatactcactcttaaaaaatatgaatatCCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTAc > 2:1225020‑M1/45‑150 (MQ=255) aCTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTc < 1:992288/150‑1 (MQ=255) attattAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAgc < 2:257542/150‑1 (MQ=255) tattaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAgctg < 2:449561/150‑1 (MQ=255) attaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAgctgc < 1:1393685/150‑1 (MQ=255) aaTAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCa > 2:509291/1‑150 (MQ=255) aaTAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCa > 1:1269418/1‑150 (MQ=255) aaatactcactctaaaaaaatatcaatatCCCCTCCAGTGTCCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCg > 1:483235‑M1/30‑150 (MQ=255) acacATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCa < 1:1620464/147‑1 (MQ=255) cTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCAt < 1:776630/150‑1 (MQ=255) cATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATgg > 1:20233/1‑150 (MQ=255) cATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATgg > 1:140527/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGggcggc < 2:278188/150‑1 (MQ=255) tGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAg > 2:1471361/1‑150 (MQ=255) tttATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTa > 2:1297900/1‑150 (MQ=255) tattaATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTaaa > 1:1194643/1‑150 (MQ=255) attaattaGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAgctgc < 2:1177040/125‑1 (MQ=255) attaattaGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAgctgc > 1:1177040/1‑125 (MQ=255) attaattaGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAg > 2:1614652/1‑150 (MQ=255) attaattaGTACCCCTCCACTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAAATTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCAGCTCATCCGAATGTGCGGCAGGTAAAg > 2:1003264/1‑150 (MQ=255) ttaattaGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAgg < 1:513587/150‑1 (MQ=255) ttaattaGTACCCCTCCAGGGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAgg > 2:297391/1‑150 (MQ=255) taattaGTACCCCTCCAGTGTTctggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagcgatataatcaactttaaaagtc < 2:7658‑M2/150‑129 (MQ=255) aattaGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCg > 2:1082758/1‑150 (MQ=255) ttaGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTCCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCggg < 2:217067/150‑1 (MQ=255) aGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGAt < 2:194223/150‑1 (MQ=255) gTACCCCTCCAGTGTTctggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagcgatataatcaactttaaaagtcaacgtc < 2:976242‑M2/150‑135 (MQ=255) ccccTCCAGTGTTctggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttcttttaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagcgatataatcaactttaaaagtcaacgtctga < 1:1234647‑M2/150‑138 (MQ=255) cccTCCAGaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagcgatataatcaactttaaaagtcaacgtctgat < 2:10605‑M1/150‑143 (MQ=255) CCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGAc < 1:304291‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGAc > 1:530552‑M1/1‑150 (MQ=255) CTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACtt < 1:268606‑M1/150‑1 (MQ=255) ccAGaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagcgatataatcaactttaaaagtcaacgtctgatctcc > 2:518727‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAGaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagcgatataatcaactttaaaagtcaacgtctgatctcc > 2:1396995‑M1/1‑4 (MQ=255) CAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTgca > 2:1383396‑M1/1‑150 (MQ=255) aGaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagcgatataatcaactttaaaagtcaacgtctgatctccat < 2:1125787‑M1/150‑149 (MQ=255) aGaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagagatataatcaactttaaaagtcaacgtctgatctccat > 1:662879‑M1/1‑2 (MQ=255) gaacactggaggggtactaattaataaaacaattaatgagttctattaataatagttaatatggaaatttgttaccgcattcacattacctgaagtcgctttccccgtagcgatataatcaactttaaaagtcaacgtctgatctccatc < 2:1491228‑M1/150‑150 (MQ=255) GTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTgcagc < 1:802548‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAATATTACTCAGCTGCTCATCCGCATGGGCGGCAGGTAAAGGCGGGATTGGACTTGCAGC > NC_000913/998298‑998596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |