| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 473497 = | 71 (0.750) | 6 (0.070) | 4/258 | NT | 8.2% | coding (532/1287 nt) | amtB | ammonia/ammonium transporter |
| ? | NC_000913 | 473530 = | 68 (0.760) | coding (565/1287 nt) | amtB | ammonia/ammonium transporter | |||||
TTTGCCTGCATTACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGAC > NC_000913/473350‑473645 | tttGCCTGCATTACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCAc < 2:1409813/150‑1 (MQ=255)aaagccaaaccaaccgatatagagaatggcagtcccggtgaagaccatcggcaggttgtgcggtttaaacgcctctttaccgaagcccacgcgttttcctatcagatacgcgcccaccagaccggcgattgcggcgttaatgtgcaccac < 1:225989‑M1/3‑1 (MQ=255) ttGCCTGCATTACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACg > 2:1347407/1‑150 (MQ=255) ccaaaccaaccgatatagagaatggcagtcccggtgaagaccatcggcaggttgtgcggtttaaacgcctctttaccgaagcccacgcgttttcctatcagatacgcgcccaccagaccggcgattgcggcgttaatgtgcacCACGGTg > 2:225989‑M1/144‑150 (MQ=255) ccaaaccaaccgatatagagaatggcagtcccggtgaagaccatcggcaggttgtgcggtttaaacgcctctttaccgaagcccacgcgttttcctatcagatacgcgcccaccagaccggcgattgcggcgttaatgtgcacCACGGTg < 2:926519‑M1/7‑1 (MQ=255) ccTGCATTACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTg > 1:1394351/1‑150 (MQ=255) caaaccaaccgatatagagaatggcagtcccggtgaagaccatcggcaggttgtgcggtttaaacgcctctttaccgaagcccacgcgttttcctatcagatacgcgcccaccagaccggcgattgcggcgttaatgtgcacCACGGTgc > 2:1472055‑M1/143‑150 (MQ=255) caaaccaaccgatatagagaatggcagtcccggtgaagaccatcggcaggttgtgcggtttaaacgcctctttaccgaagcccacgcgttttcctatcagatacgcgcccaccagaccggcgattgcggcgttaatgtgcacCACGGTgc < 2:434356‑M1/8‑1 (MQ=255) tGCATTACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTgcg < 1:535539/150‑1 (MQ=255) aTTACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTg < 2:1506040/150‑1 (MQ=255) aTTACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGGTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTg < 1:374234/150‑1 (MQ=255) ttACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTgg < 2:1172883/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGAtt > 2:1329678/1‑150 (MQ=255) gTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTc < 2:1383162/150‑1 (MQ=255) gTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTc > 1:1369637/1‑150 (MQ=255) gTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTc > 1:1375411/1‑150 (MQ=255) ttGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGt < 2:1064249/150‑1 (MQ=255) tGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTg > 2:1234153/1‑150 (MQ=255) gATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTgg < 1:1329678/150‑1 (MQ=255) aTAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGc > 1:926519/1‑150 (MQ=255) tAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCa < 1:601604/150‑1 (MQ=255) gTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCAcc > 2:653069/1‑150 (MQ=255) gTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATACGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCAcc > 2:1096786/1‑150 (MQ=255) 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gCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACAtt < 2:182652/150‑1 (MQ=255) gAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAAc < 2:1394351/150‑1 (MQ=255) cGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAAcgcc > 1:1650434/1‑150 (MQ=255) tCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCaa < 2:706856/150‑1 (MQ=255) ggttCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCg < 1:794644/148‑1 (MQ=255) 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cATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGttt > 1:170563/1‑147 (MQ=255) tGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAAACGc > 2:1286485/1‑150 (MQ=255) tgtgGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGcaca > 2:301184/1‑150 (MQ=255) ggtgGGGCGGTGGGTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGcaca < 1:425498/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGCGGCGTTTAAACCGCACAACCTGc > 1:278553/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGcc < 2:1555613/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGGACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCTCCGGTCTGGGGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGcc < 2:1612522/150‑1 (MQ=255) gtTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAAACGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATgg < 1:1643046/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTc > 1:353475/1‑150 (MQ=255) cTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCg > 2:611205/1‑150 (MQ=255) cTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCACACAACCTGCCGATGGTCTTCACCg > 1:563203/1‑150 (MQ=255) cTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGAGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGGTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTACACCg > 2:459721/1‑150 (MQ=255) ttCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCgg < 2:1080614/150‑1 (MQ=255) ttCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCG‑TTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCggg < 1:611845/150‑1 (MQ=255) tcACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAACCCGCACCACCTGCAGATGGTCTTCAACGGGAc > 1:1668556/1‑150 (MQ=255) tcACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGAc > 2:367984/1‑150 (MQ=255) tcACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGAc > 2:361821/1‑150 (MQ=255) | TTTGCCTGCATTACCGTCGGCTTGATAGTTGGGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGAC > NC_000913/473350‑473645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |