| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 473497 = | 71 (0.750) | 6 (0.070) | 4/258 | NT | 8.2% | coding (532/1287 nt) | amtB | ammonia/ammonium transporter |
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GGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCGGTTGGTTTGGCTTT > NC_000913/473381‑473676 | gtcccggtgaagaccatcggcaggttgtgcggtttaaacgcctctttaccgaagcccacgcgttttcctatcagatacgcgcccaccagaccggcgattgcggcgttaatgtgcacCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCgtgg > 2:260981‑M1/117‑150 (MQ=255)gggCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCgtgg < 1:394349/150‑1 (MQ=255)gggCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCgtgg < 1:926556/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) TGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCAt > 2:185562‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCAt > 2:1619193‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCAtt < 2:1140404‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTc > 2:1535359‑M1/1‑150 (MQ=255) gcTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATtct > 1:1460884/1‑150 (MQ=255) cTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGcac > 1:1579733/1‑114 (MQ=255) cTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGcac < 2:1579733/114‑1 (MQ=255) cTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATtctc < 1:301184/150‑1 (MQ=255) aTTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCtata > 2:1596848/1‑150 (MQ=255) cgGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCggtt > 1:78063/1‑150 (MQ=255) cgGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCggtt < 2:78063/150‑1 (MQ=255) cgGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCggtt < 1:1347407/150‑1 (MQ=255) ggTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCggttgg < 1:1642510/150‑1 (MQ=255) ggTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCggttgg > 2:1424446/1‑150 (MQ=255) gcaccgtgGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCGGTTGGTTTg < 2:434356‑M2/142‑1 (MQ=255) gcaccgtgGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCGGTTGGTTTg > 2:1472055‑M2/9‑150 (MQ=255) caccgtgGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCGGTTGGTTTgg > 2:225989‑M2/8‑150 (MQ=255) caccgtgGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCGGTTGGTTTgg < 2:926519‑M2/143‑1 (MQ=255) gtgGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCGGTTGGTTTGGCttt < 1:225989‑M2/147‑1 (MQ=255) | GGGCGCTGGCGGAACGAATCCGCTTCTCAGCTGTGTTGATTTTCGTGGTGGTATGGCTGACGCTCTCTTACATTCCGATTGCGCATATGGTGTGGGGCGGTGGTTTGCTGGCTTCTCACGGTGCGCTGGATTTCGCGGGTGGCACCGTGGTGCACATTAACGCCGCAATCGCCGGTCTGGTGGGCGCGTATCTGATAGGAAAACGCGTGGGCTTCGGTAAAGAGGCGTTTAAACCGCACAACCTGCCGATGGTCTTCACCGGGACTGCCATTCTCTATATCGGTTGGTTTGGCTTT > NC_000913/473381‑473676 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |