New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 916207 | 89 (0.990) | intergenic (‑160/‑266) | aqpZ/ybjD | water channel AqpZ/DUF2813 domain‑containing protein YbjD |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTTTGTTGTTTTTGCAGACTTATCAGCAAGAGGGAGTATAACG > NC_000913/916053‑916351 | ccacAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAATTATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAAC < 1:1420037‑M1/150‑1 (MQ=255) ccacAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAAC < 1:1634761‑M1/150‑1 (MQ=255) aTTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCgg > 1:175961/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCgg < 2:201075/150‑1 (MQ=255) ttAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGg < 1:1341835‑M2/150‑2 (MQ=255) ttAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACAAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGg < 1:870429‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaaaTTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGgtt < 2:406793‑M2/150‑4 (MQ=255) aaaTTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACTACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGgttgc > 2:843062‑M2/1‑145 (MQ=255) aTTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGCAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGgttgccc > 2:609838‑M2/1‑143 (MQ=255) ttGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGcccc < 1:1522013/150‑1 (MQ=255) aCCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACccgctgttgccctaaa < 1:934160‑M1/150‑17 (MQ=255) aCCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCata < 2:1538393/150‑1 (MQ=255) tgAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACccgctgttgccctaaatcaaat > 1:264654‑M1/1‑128 (MQ=255) 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CCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTTTGTTGTTTTTGCAGACTTATCAGCAAGAGGGAGTATAACG > NC_000913/916053‑916351 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |