| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 916202 | 90 (0.950) | 6 (0.070) | 6/260 | NT | 6.4% | intergenic (‑155/‑271) | aqpZ/ybjD | water channel AqpZ/DUF2813 domain‑containing protein YbjD |
| ? | NC_000913 | = 916207 | 89 (0.990) | intergenic (‑160/‑266) | aqpZ/ybjD | water channel AqpZ/DUF2813 domain‑containing protein YbjD | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
ATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTTTGTTGTTTTTGCAGACTTATCAGCAAGAGGGAGTATAACGCGATT > NC_000913/916058‑916356 | aTTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCgg > 1:175961/1‑150 (MQ=255) ttAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGg < 1:1341835‑M2/150‑2 (MQ=255) ttAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGg < 2:231316‑M2/150‑2 (MQ=255) ttAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACAAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGg < 1:870429‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaaaTTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGgtt < 2:406793‑M2/150‑4 (MQ=255) aaaTTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACTACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGgttgc > 2:843062‑M2/1‑145 (MQ=255) aTTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGCAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGgttgccc > 2:609838‑M2/1‑143 (MQ=255) ttGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGcccc < 1:1522013/150‑1 (MQ=255) tgAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCa < 1:1242956/150‑1 (MQ=255) gAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCAt > 1:345608/1‑150 (MQ=255) gAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCAt > 1:415402/1‑150 (MQ=255) gAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCAt > 1:558474/1‑150 (MQ=255) aaaaTATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCAttt < 1:1057630/150‑1 (MQ=255) aaaTATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTg < 2:206455/150‑1 (MQ=255) atatGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTc < 2:1535025/150‑1 (MQ=255) atGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTg < 1:286004/150‑1 (MQ=255) gTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCAATCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGTGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGAtt < 1:1063775/150‑1 (MQ=255) tCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTg > 1:726982/1‑150 (MQ=255) 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ATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTTTGTTGTTTTTGCAGACTTATCAGCAAGAGGGAGTATAACGCGATT > NC_000913/916058‑916356 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |