New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
AGTCAGTACGCTGGTGGTTTTTCTGGTGGTGAGCTGGAGTTCGCAACTGGTACACGGTGAACGTAAAGTCGTAGGTCAGAAAGGATCAGAAGAATGATGGCGAATATCTGGTGGTCATTACCGCTGACATTGATTGTCTTTTTTGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATCTGCTGCAACCGG > NC_000913/2230926‑2231223 | agtcagtACGCTGGTGGTTTTTCTGGTGGTGAGCTGGAGTTCGCAACTGGTACACGGTGAACGTAAAGTCGTAGGTCAGAAAGGATCAGAAGAATGATGGCGAATATCTGGTGGTCATTACCGCTGACATTGATTGTCTTTTTTGCCGCC > 2:1633985‑M1/1‑150 (MQ=255) gtcagtACGCTGGTGGTTTTTCTGGTGGTGAGCTGGAGTTCGCAACTGGTACACGGTGAACGTAAAGTCGTAGGTCAGAAAGGATCAGAAGAATGATGGCGAATATCTGGTGGTCATTACCGCTGACATTGATTGTCTTTTTTGccgccc > 1:943317/1‑150 (MQ=255) tcagtACGCTGGTGGTTTTTCTGGTGGTGAGCTGGAGTTCGCAACTGGTACACGGTGAACGTAAAGTCGTAGGTCAGAAAGGATCAGAAGAATGATGGCGAATATCTGGTGGTCATTACCGCTGACATTGATTGTCTTTTTTGccgcccg < 1:771976/150‑1 (MQ=255) 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< 2:217516‑M2/109‑87 (MQ=255) gTCTTTTTTGCCGCCCGCAAACTggcggcaaaaaagacaatcaatgtcagcggtaatgaccaccagatattcgccatcattcttctgatcctttctgacctacgacttt > 1:217516‑M2/1‑23 (MQ=255) gTCTTTTTTGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGAt > 1:1180805/1‑150 (MQ=255) tCTTTTTTGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATc < 1:1029971/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTTGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATc < 1:1035972/150‑1 (MQ=255) cTTTTTTGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATct > 1:578130/1‑150 (MQ=255) ttttttGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATctg < 2:912189/150‑1 (MQ=255) tttttGCCGCCCGCAAACTggcggcaaaaaagacaatcaatgtcagcggtaatgaccaccagatattcgccatcattcttctgatcctttctgacctacgactttacgttcaccgtgtaccagttgcgaactccagctccccaccagaaa < 1:66562‑M2/150‑132 (MQ=255) tttttGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATctgc < 1:98859/150‑1 (MQ=255) tttGCCGCCCGCAAACTggcggcaaaaaagacaatcaatgtcagcggtaatgaccaccagatattcgccatcattcttctgatcctttctgacctacgactttacgttcaccgtgtaccagttgcgaactccagctcaccaccagaaaaa < 1:1128351‑M2/150‑134 (MQ=255) gccgccCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATCTGCTGCaa > 1:280920/1‑150 (MQ=255) ccgcccgcAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATCTGCTGCAAc < 2:608193/150‑1 (MQ=255) cgccagtttgcgggcggcaaaaaagacaatcaatgtcagcggtaatgaccaccagatattcgccatcattcttctgatcctttgtgacctacgactttacgttcaccgtgtaccagttgcgaactccagctcaccaccagaaaaaccacc < 1:981743‑M1/150‑147 (MQ=255) cgccagtttgcgggcggcaaaaaagacaatcaaagtcagcggtaatgaccaccagatattcgcaatcattcttctcatacttactgacctacgactttacgttcaacgttaaccagttgcgaactccagctcaccacaagaaaaaccacc > 2:521834‑M1/1‑4 (MQ=255) cccgcAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATCTGCTGCAACcgg > 2:1434991/1‑150 (MQ=255) | AGTCAGTACGCTGGTGGTTTTTCTGGTGGTGAGCTGGAGTTCGCAACTGGTACACGGTGAACGTAAAGTCGTAGGTCAGAAAGGATCAGAAGAATGATGGCGAATATCTGGTGGTCATTACCGCTGACATTGATTGTCTTTTTTGCCGCCCGCAAACTGGCGGCACGGTATAAGTTTCCCTTGCTTAACCCGTTGCTGGTAGCAATGGTGGTGATCATTCCTTTTTTAATGCTGACTGGCATCTCTTACGACAGCTACTTTAAAGGTAGCGAAGTGCTAAACGATCTGCTGCAACCGG > NC_000913/2230926‑2231223 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |