New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2805904 | 69 (0.730) | 5 (0.050) | 5/266 | NT | 6.7% | coding (1090/1203 nt) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
? | NC_000913 | = 2805932 | 73 (0.790) | coding (1118/1203 nt) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
CGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGA > NC_000913/2805756‑2806053 | cGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCgg < 1:518181/150‑1 (MQ=255) cGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCgg < 2:323500/150‑1 (MQ=255) cgGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGc > 1:611045/1‑150 (MQ=255) aGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCtgtg > 1:1513373/1‑150 (MQ=255) aGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCtgtg > 2:373110/1‑150 (MQ=255) gTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTgcgc > 1:1002622/1‑150 (MQ=255) gTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGc > 1:746438/1‑150 (MQ=255) gTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGc < 1:793774/150‑1 (MQ=255) 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ctctcATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGc > 2:1374577/1‑150 (MQ=255) tctcATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTcgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaacggcgcatcaatcagcgccgcatcaagaccttgctgctgcgttaacgcggttttaagcgaatc < 1:358648‑M2/150‑113 (MQ=255) tctcATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGcc < 2:555375/150‑1 (MQ=255) gTCGaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaacggcgcatcaatcagcgccgcatcaagaccttgctgctgcgttaacgcggttttaagcgaatcgatgga > 2:1215632‑M1/1‑4 (MQ=255) gTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTcgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaacggcgcatcaatcagcgccgcatcaagaccttgctgctgcgttaacgcggttttaagcgaatcgatgga < 2:1008389‑M2/150‑119 (MQ=255) gTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAgcggc > 2:1306908/1‑150 (MQ=255) gTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAgcggc > 2:197014/1‑150 (MQ=255) gTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAgcggc > 2:191042/1‑150 (MQ=255) tCGaccacgggcaccgcacagggtgcctgtccgacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaacggcgcatcaatcagcgccgcatcaagaccttgctgctgcgttaacgcggttttaagcgaatcgatggag < 1:1384405‑M1/150‑148 (MQ=255) tCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAgcggcg < 2:746438/150‑1 (MQ=255) cGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCTGTC‑gacatgagagagcaactcgctaagaggcgtttgtgcatcgactgctaacggcgcatcaatcagcgccgcatcaagaccttgctgctgcgttaacgcggttttaagcgaatcgatggagact < 2:1206886‑M2/150‑122 (MQ=255) cGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGcggcgg > 1:1328119/1‑150 (MQ=255) ggACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGa > 2:941507/1‑150 (MQ=255) | CGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGA > NC_000913/2805756‑2806053 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |