New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2805904 | 69 (0.730) | 5 (0.050) | 5/266 | NT | 6.7% | coding (1090/1203 nt) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
? | NC_000913 | = 2805932 | 73 (0.790) | coding (1118/1203 nt) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
CTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATCCGCAGACGCCTGG > NC_000913/2805786‑2806081 | ctcCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTcga < 1:1384405‑M2/150‑4 (MQ=255) tcCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTcgac > 2:1215632‑M2/1‑146 (MQ=255) ccATCGATTCGGTTAAAAGGGCGTTATCGCAGCAGCAAGGGCTTGATGGGGGGCTGTTTGATGGGGCGTTAGGAGTCGATGCAGATACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCTCCGTGTGCGGTGCCCGTGGTcgacg < 2:342206/150‑1 (MQ=255) ccATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTcgacg > 1:1075763/1‑150 (MQ=255) tCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAgg < 1:939355/150‑1 (MQ=255) tCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAgg < 1:373110/150‑1 (MQ=255) tCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAgg > 2:1330798/1‑150 (MQ=255) aTTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGAcc < 1:1077360/150‑1 (MQ=255) aTTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGAcc < 2:1074017/150‑1 (MQ=255) aTTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGAcc < 2:1094850/150‑1 (MQ=255) aTTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAACAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGAcc > 2:1017594/1‑150 (MQ=255) cGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAAc < 1:1659199/150‑1 (MQ=255) cGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAAc > 1:394452/1‑150 (MQ=255) gCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCGACa > 2:491019/1‑150 (MQ=255) gCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACa > 2:836649/1‑150 (MQ=255) tAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGTCCAACAGTa < 2:1017998/150‑1 (MQ=255) tAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTa > 1:950826/1‑150 (MQ=255) tAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCCGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTa < 1:1181253/150‑1 (MQ=255) aaaaCCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTAt > 2:459984/1‑150 (MQ=255) aCCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTc > 1:1529897/1‑150 (MQ=255) aCCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTc > 1:576700/1‑150 (MQ=255) cagcagcaAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCg < 2:611045/150‑1 (MQ=255) gcagcaAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCAACCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGaa < 2:442690/150‑1 (MQ=255) gcaAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAgg < 1:1330798/150‑1 (MQ=255) aaGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGaa > 1:1350207/1‑150 (MQ=255) gTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAAtgc < 2:1529897/150‑1 (MQ=255) gATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAAtgctgctg < 1:459984/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTgcg > 1:87805/1‑150 (MQ=255) 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tgattgatGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAg > 2:675920/1‑150 (MQ=255) atGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTg > 1:1621784/1‑150 (MQ=255) gcgcCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAg > 1:1561361/1‑150 (MQ=255) cgcCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCGACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAgg < 1:491019/150‑1 (MQ=255) cgcCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACACGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAgg > 2:1056618/1‑150 (MQ=255) 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ggCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTg < 2:950826/150‑1 (MQ=255) ggCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTg > 1:604859/1‑150 (MQ=255) ggCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTg > 1:1362926/1‑150 (MQ=255) gCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGc > 2:1493046/1‑150 (MQ=255) gCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACACCAGCGGCGGACAGTGc > 1:996243/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCcgcg < 2:1561361/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCgcgc < 2:1497603/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATcc < 2:1362926/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATcc < 2:1077056/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATcc < 1:1017594/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATCCGCAGAc < 2:576700/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATCCGCAGAc > 2:1490668/1‑150 (MQ=255) tCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCCCGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATCCGCAGCCGCCTgg > 2:808933/1‑150 (MQ=255) tCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATCCGCAGACGCCTgg > 2:284953/1‑150 (MQ=255) tCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATCCGCAGACGCCTgg > 1:1578600/1‑150 (MQ=255) | CTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGTTAACGCAGCAGCAAGGTCTTGATGCGGCGCTGATTGATGCGCCGTTAGCAGTCGATGCACAAACGCCTCTTAGCGAGTTGCTCTCTCATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGAAAGGAATGCTGCTGCGCGCTTTAGATCGTGAGGGGGTAAATAATGGCTGATCAAAATAATCCGTGGGATACCACGCCAGCGGCGGACAGTGCCGCGCAATCCGCAGACGCCTGG > NC_000913/2805786‑2806081 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |