| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3473495 = | 88 (0.960) | coding (20/2115 nt) | fusA | elongation factor G | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GCAGCGGAAGTGATGGTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATA > NC_000913/3473315‑3473612 | gCAGCGGAAGTGATGGTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTgc > 2:49824/1‑150 (MQ=255)gCAGCGGAAGTGATGGTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTgc > 2:357422/1‑150 (MQ=255)gCAGCGGAAGTGATGGTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTgc < 1:1451647/150‑1 (MQ=255) ccaacaaggcgttcgcacactaccgttggttatcccttcggagttttagtcaccaggcgggcgcttccagtaagcagcccgctttgggctacttaaattgaacgcctaaaagataaacgaggaaacaaatggctcgtacaacacccatCg < 2:328307‑M1/2‑1 (MQ=255) ccaacaaggcgttcgcacactaccgttggttatcccttcggagttttagtcaccaggcgggcgcttccagtaagcagcccgctttgggctacttaaattgaacgcctaaaagataaacgaggaaacaaatggctcgtacaacacccatCg > 1:319270‑M1/149‑150 (MQ=255) caacaaggcgttcgcacactaccgttggttatcccttcggagttttagtcaccaggcgggcgcttccagtaagcagcccgctttgggctacttaaattgaacgcctaaaagataaacgaggaaacaaatggctcgtacaacacccatCGc > 2:1421996‑M1/148‑150 (MQ=255) gCGGAAGTGATGGTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCa > 1:438067/1‑150 (MQ=255) acaaggcgttcgcacactaccgttggttatcccttcggagttttagtcaccaggcgggcgcttccagtaagcagcccgctttgggctacttaaattgaacgcctaaaagataaacgaggaaacaaatggctcgtacaacacccatCGCAc < 2:133990‑M1/5‑1 (MQ=255) tGATGGTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATAc > 1:1609600/1‑150 (MQ=255) aTGGTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCg < 2:438067/150‑1 (MQ=255) tGGTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGa > 2:477587/1‑150 (MQ=255) gTAATACCACGTTCCTGCTCCTTCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGTGCGGTCATGAACTTCACCGATTTTATTGTTTACACAGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGAACTGATACCGATg < 2:1427709/150‑1 (MQ=255) gTAATACCACGTTCCTGCTCCTGCTCCATCCATTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATTAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATg < 1:1470264/150‑1 (MQ=255) 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ccaGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACg > 2:117721/1‑150 (MQ=255) ccaGTCCATGGTTGCAGCACCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACg < 2:163198/150‑1 (MQ=255) tCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGcc < 2:452352/150‑1 (MQ=255) tCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGcc > 2:661050/1‑150 (MQ=255) tCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGcc > 2:537807/1‑150 (MQ=255) 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tGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGt < 1:681180/150‑1 (MQ=255) gggTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGC‑GCTTCCAGTAAGCAgcccgctttgg < 2:809352/149‑6 (MQ=255) ggTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTg < 2:1649319/150‑1 (MQ=255) ggTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTg < 2:1177875/150‑1 (MQ=255) gTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGC‑GCTTCCAGTAAGCAgcccgctttgggc < 1:1279748/150‑8 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |