| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCGAACGCCTTGTTGG > NC_000913/3473346‑3473642 | ctcctgctccATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGAt > 1:1339544/1‑150 (MQ=255) atcccttcggagttttagtcaccaggcgggcgcttccagtaagcagcccgctttgggctacttaaattgaacgcctaaaagataaacgaggaaacaaatggctcgtacaacacccatCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGAt < 2:231643‑M1/33‑1 (MQ=255) tcctgctccATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATg < 2:523870/150‑1 (MQ=255) ctgctccATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATggg < 2:1146669/150‑1 (MQ=255) tccatccaGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGtgtt > 1:827051/1‑150 (MQ=255) ccatccaGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGtgttg > 2:1283426/1‑150 (MQ=255) ccatccaGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGtgttg > 1:1282989/1‑150 (MQ=255) catccaGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGtgttgt < 2:1233150/150‑1 (MQ=255) tccaGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTAc > 1:452352/1‑150 (MQ=255) tccaGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTAc > 2:571962/1‑150 (MQ=255) gttttagtcaccaggcgggcgcttccagtaagcagcccgctttgggctacttaaattgaacgcctaaaagataaacgaggaaacaaatggctcgtacaacacccatCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATggg > 1:558309‑M1/107‑142 (MQ=255) gttttagtcaccaggcgggcgcttccagtaagcagcccgctttgggctacttaaattgaacgcctaaaagataaacgaggaaacaaatggctcgtacaacacccatCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATggg > 1:563893‑M1/107‑142 (MQ=255) gttttagtcaccaggcgggcgcttccagtaagcagcccgctttgggctacttaaattgaacgcctaaaagataaacgaggaaacaaatggctcgtacaacacccatCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATggg < 2:558309‑M1/36‑1 (MQ=255) 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tgCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATTTGTGTTGTAAGAGACATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGAt < 2:1459279/150‑1 (MQ=255) atcgcacgctaccgtaacatcggtatcagtgcgATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGAt < 2:231643‑M2/117‑1 (MQ=255) gcgcACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATa > 1:630844/1‑150 (MQ=255) CTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCaa < 2:1010678‑M1/150‑1 (MQ=255) tACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGt > 1:601188/1‑150 (MQ=255) tACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGt > 1:1437/1‑150 (MQ=255) ccGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAg > 1:617384/1‑150 (MQ=255) ccGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAg > 1:348576/1‑150 (MQ=255) tGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGtgtg < 2:1339544/150‑1 (MQ=255) ttACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCg > 1:298481/1‑150 (MQ=255) ttACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCg < 2:1421520/150‑1 (MQ=255) gCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCGAACGCCtt > 1:1412823/1‑150 (MQ=255) cGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCGAACGCCttg < 1:763799/150‑1 (MQ=255) gtgcgATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCGAACGCCttgt < 2:133990‑M2/145‑1 (MQ=255) gcgATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCGAACGCCttgttg > 2:1421996‑M2/4‑150 (MQ=255) cgATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCGAACGCCTTGTTgg > 1:319270‑M2/3‑150 (MQ=255) cgATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCGAACGCCTTGTTgg < 2:328307‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCTCCTGCTCCATCCAGTCCATGGTTGCAGCGCCGTCATGAACTTCACCGATTTTATGGTTTACACCGGTGTAGAACAGAATACGTTCGGTAGTAGTGGTTTTACCGGCGTCGATGTGCGCACTGATACCGATGTTACGGTAGCGTGCGATGGGTGTTGTACGAGCCATTTGTTTCCTCGTTTATCTTTTAGGCGTTCAATTTAAGTAGCCCAAAGCGGGCTGCTTACTGGAAGC‑GCCCGCCTGGTGACTAAAACTCCGAAGGGATAACCAACGGTAGTGTGCGAACGCCTTGTTGG > NC_000913/3473346‑3473642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |