New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 3556490 = | 83 (0.890) | coding (360/1017 nt) | rtcA | RNA 3'‑terminal phosphate cyclase |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CACGCATCTGCACAATGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAA > NC_000913/3556273‑3556559 | tggggtcgcagcgtctgctcttccgggccggcaccgtgcgcggcggcgattaccgctttgctatcggtagcgccggaagttgtacgctggtgctgcaaacggtgctgcccgcgctgtggtttgccgatggaccttcgcgtgttgaagtga < 1:614730‑M1/1‑1 (MQ=255) tCTGCACAATGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCg > 2:1231317/1‑150 (MQ=255) cTGCACAATGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCgg > 1:749924/1‑150 (MQ=255) gCACAATGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCt > 1:75209/1‑150 (MQ=255) gCACAATGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCt > 1:1174716/1‑150 (MQ=255) gtctgctcttccggcccggcaccgtgcgcggcggcgattaccgctttgctatcggtagcgccggaagttgtacgctggtgctgcaaacggtgctgcccgcgctgtggtttgccgatggaccttcgcgtgttgaagtgAGCAGCGGCTCCa < 2:180722‑M1/13‑1 (MQ=255) caATGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCa < 1:1382680/150‑1 (MQ=255) caATGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCa < 2:1667276/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAg < 1:379649/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCCGCGGCTCCAGCa > 2:287867/1‑150 (MQ=255) tGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCa > 2:1079408/1‑150 (MQ=255) tCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCAccc < 1:280640/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCcgg > 2:295128/1‑150 (MQ=255) 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gCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTgcagca > 1:173152/1‑150 (MQ=255) cTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCAc > 1:332426/1‑150 (MQ=255) cTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCAc < 2:173152/150‑1 (MQ=255) tgatgaATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAac < 2:591696/98‑1 (MQ=255) tgatgaATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAac > 1:591696/1‑98 (MQ=255) tgatgaATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCAcc > 1:1326086/1‑150 (MQ=255) 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ccTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACaa > 1:97031/1‑150 (MQ=255) | CACGCATCTGCACAATGTTCCCGCGCTCGCCAAGTTGCAAGGTGTTAAACGATGCCACGGGCGAGACTTCCGTTGCCACCACACCGCCTCCGGCAGGGTAAAAACCGTGGCGTAACAGCGTGGTTTGCTGATGAATTCCTATTTTCGCCAGCAGCGGCTCCAGCACCCGGCGGATAAAATCCGCAGGCGGCGCCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAA > NC_000913/3556273‑3556559 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |