| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3869187 | 70 (0.740) | 7 (0.080) | 5/262 | NT | 9.2% | coding (123/1248 nt) | yidR | DUF3748 domain‑containing galacturonate catabolism protein YidR |
| ? | NC_000913 | = 3869215 | 71 (0.780) | coding (95/1248 nt) | yidR | DUF3748 domain‑containing galacturonate catabolism protein YidR | |||||
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TGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAG > NC_000913/3869042‑3869336 | tGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTGACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGGGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGt < 2:734370/150‑1 (MQ=255)tGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGt > 2:809305/1‑150 (MQ=255) gAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTc > 2:1421865/1‑150 (MQ=255) 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aCTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGc < 1:1629404/150‑1 (MQ=255) aCTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGc < 2:649682/150‑1 (MQ=255) aCTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGc < 1:669563/150‑1 (MQ=255) cTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCt > 2:51102/1‑150 (MQ=255) ggATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCg > 2:1572477/1‑150 (MQ=255) 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aaGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccagtgagcgtgtgaatatccataccggcgcggtcgcggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacccgtcggcggggtgac < 2:1599446‑M2/150‑115 (MQ=255) aGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgc > 1:776562‑M2/1‑35 (MQ=255) aGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgc < 2:776562‑M2/131‑97 (MQ=255) ggACGCccgacagccagtggctgatatttgacgtgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgaccg > 1:1108352‑M1/1‑6 (MQ=255) gACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatcaatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgaccgt < 1:599519‑M2/150‑118 (MQ=255) gACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGCCTTCACtt > 1:934340/1‑150 (MQ=255) gACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACtt > 1:1435361/1‑150 (MQ=255) cGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTc < 2:691161/150‑1 (MQ=255) cGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTc < 2:1433827/150‑1 (MQ=255) gCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCa < 1:1421865/150‑1 (MQ=255) cccgacagccagtggctggtatttgacgtgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgaccgttcat > 2:1478690‑M1/1‑1 (MQ=255) cccgacagccagtggctggtatttgacgtgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgaccgttcat > 1:285162‑M1/1‑1 (MQ=255) cACGTCAAATACGATTCACTGGCTGTGGGGCGTGCAGGTTTTTGTATTGGTGATCTGGTTATTTCGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTAATGTCTAGGTGCTGATACAAAACGTGTCCCTCCATCATACTTCACAAGGAGTTCACttttat < 2:1448494/150‑4 (MQ=255) cACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAg < 1:407825/150‑1 (MQ=255) cACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAg > 2:855654/1‑150 (MQ=255) | TGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAG > NC_000913/3869042‑3869336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |