New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3869187 | 70 (0.740) | 7 (0.080) | 5/262 | NT | 9.2% | coding (123/1248 nt) | yidR | DUF3748 domain‑containing galacturonate catabolism protein YidR |
? | NC_000913 | = 3869215 | 71 (0.780) | coding (95/1248 nt) | yidR | DUF3748 domain‑containing galacturonate catabolism protein YidR |
GATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGTGATGAA > NC_000913/3869066‑3869363 | gATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCgg < 1:1195049/150‑1 (MQ=255) aTGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGg > 2:1478690‑M2/1‑149 (MQ=255) aTGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGg > 1:285162‑M2/1‑149 (MQ=255) cGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATATCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtcc > 1:1108352‑M2/1‑144 (MQ=255) ggTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGGGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCa > 1:1614806/1‑150 (MQ=255) caccacGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggt < 1:809305/150‑1 (MQ=255) acGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtattg < 2:4345/150‑1 (MQ=255) cGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtattgg < 1:1435521/150‑1 (MQ=255) gCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAggtattggt < 1:567856/150‑1 (MQ=255) cccTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAgg < 2:509292/150‑1 (MQ=255) ccTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGt < 2:1090128/150‑1 (MQ=255) cTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTTTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTg < 2:658509/150‑1 (MQ=255) gACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTa > 1:1034541/1‑150 (MQ=255) gACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTa > 2:886938/1‑150 (MQ=255) aCGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTAc > 1:1669688/1‑150 (MQ=255) aCGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTAc > 1:1087828/1‑150 (MQ=255) cgcgcgATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACg > 2:1087238/1‑150 (MQ=255) cgcgcgATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACg > 1:952555/1‑150 (MQ=255) 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cgCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCa > 2:638381/1‑150 (MQ=255) cgCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCa > 2:1502583/1‑150 (MQ=255) ggTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGgc < 1:454356/150‑1 (MQ=255) tATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGgcgc < 1:308923/150‑1 (MQ=255) tATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGgcgc > 1:7357/1‑150 (MQ=255) 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tGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGtga > 2:334926/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGtgat > 1:59808/1‑150 (MQ=255) gggCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACGAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGTGATGaa < 1:638381/150‑1 (MQ=255) | GATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGTGATGAA > NC_000913/3869066‑3869363 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |