| New junction evidence | |||||||||||
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CAGTTCACCAATAATGGCGGTCGTGTCGATGCGGTGTACATTGTGGCAACGCCGGGTGAAATCGCTTTTATCAAACCGATGATCGCCATGCGTAACGGTAGCCAGAGCGGTGCAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGC > NC_000913/3294978‑3295271 | cAGTTCACCAATAATGGCGGTCGTGTCGATGCGGTGTACATTGTGGCAACGCCGGGTGAAATCGCTTTTATCAAACCGATGATCGCCATGCGTAACGGTAGCCAGAGCGGTGCAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGAcc < 1:477445/150‑1 (MQ=255) gTTCACCAATAATGGCGGTCGTGTCGATGCGGTGTACATTGTGGCAACGCCGGGTGAAATCGCTTTTATCAAACCGATGATCGCCATGCGTAACGGTAGCCAGAGCGGTGCAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCgc > 2:151233‑M2/1‑148 (MQ=255) cACCAATAATGGCGGTCGTGTCGATGCGGTGTACATTGTGGCAACGCCGGGTGAAATCGCTTTTATCAAACCGATGATCGCCATGCGTAACGGTAGCCAGAGCGGTGCAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCgctgg < 2:1643747‑M2/150‑6 (MQ=255) 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aGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATggg < 2:598900/150‑1 (MQ=255) aGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATggg < 2:222473/150‑1 (MQ=255) gggACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGc > 1:1092750/1‑150 (MQ=255) | CAGTTCACCAATAATGGCGGTCGTGTCGATGCGGTGTACATTGTGGCAACGCCGGGTGAAATCGCTTTTATCAAACCGATGATCGCCATGCGTAACGGTAGCCAGAGCGGTGCAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGC > NC_000913/3294978‑3295271 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |