| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4104183 | 87 (0.910) | 5 (0.050) | 5/262 | NT | 5.5% | coding (793/1374 nt) | cpxA | sensory histidine kinase CpxA |
| ? | NC_000913 | = 4104189 | 88 (0.970) | coding (787/1374 nt) | cpxA | sensory histidine kinase CpxA | |||||
CTGGTTGGCTTTGATGGTTTCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAATTCCTGTGGCCCCG > NC_000913/4104040‑4104338 | cTGGTTGGCTTTGATGGTTTCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTaa > 1:621819/1‑150 (MQ=255) tGGTTGGCTTTGATGGTTTCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAAc > 2:1326040‑M2/1‑149 (MQ=255) gTTGGCTTTGATGGTTTCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAAcgc < 1:187873‑M2/150‑4 (MQ=255) 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gTTTCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGc < 2:187873/150‑1 (MQ=255) gTTTCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGc < 2:1469875/150‑1 (MQ=255) tttCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCa < 1:438077/150‑1 (MQ=255) tCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGa < 1:798214/150‑1 (MQ=255) tCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGa > 2:98398/1‑150 (MQ=255) 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ccTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTgg < 1:1137445/150‑1 (MQ=255) cTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGc < 1:1426413/150‑1 (MQ=255) ttGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAAcgccgtcgtagcggtgaaagcaaggaactggagcgtattgaaaccgaagcgcaacgtctggacagcatgat > 1:687905‑M2/1‑29 (MQ=255) ttGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAAcgccgtcgtagcggtgaaagcaaggaactggagcgtattgaaaccgaagcgcaacgtctggacagcatgat < 2:687905‑M2/100‑72 (MQ=255) cTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCt > 2:625490/1‑150 (MQ=255) ttCACCGCTACGACGGCGCAGTAAcgccgtcgtagcggtgaaagcaaggaactggagcgtattgaaaccgaagcgcaacgtctggacagcatgatcaacgatctgttggtgatgtcacgtaatcagcaaaaaaacgcgctggttagcgaa < 2:18406‑M2/150‑127 (MQ=255) cACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCgg < 2:621819/150‑1 (MQ=255) ccGCTACGACGGCGCAGTAAcgccgtcgtagcggtgaaagcaaggaactggagcgtattgaaaccgaagcgcaacgtctggacagcatgatcaacgatctgttggtgatgtcacgtaatcagcaaaaaaacgcgctggttagcgaaacca < 1:259247‑M2/150‑131 (MQ=255) gCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAg < 1:11116/150‑1 (MQ=255) cTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAgg < 1:192878/150‑1 (MQ=255) cTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAgg < 2:286021/150‑1 (MQ=255) tACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGa < 1:722397/150‑1 (MQ=255) acgacgGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGAGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGaa > 1:145215/1‑150 (MQ=255) cgacgGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTgg < 2:73412/123‑1 (MQ=255) cgacgGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTgg > 1:73412/1‑123 (MQ=255) cgacgGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAAt > 2:1664190/1‑150 (MQ=255) gcgcAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATGATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAATTCCtg < 2:217538/150‑1 (MQ=255) cgcAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAATTCCtgt > 2:720833/1‑150 (MQ=255) gcAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAATTCCtgtg < 1:1380719/150‑1 (MQ=255) cAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGACAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAATTCCTGTgg > 1:1176050/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAATTCCTGTGGcccc > 1:1357553/1‑150 (MQ=255) aCGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAATTCCTGTGGCCCCg < 2:547094/150‑1 (MQ=255) | CTGGTTGGCTTTGATGGTTTCGCTAACCAGCGCGTTTTTTTGCTGATTACGTGACATCACCAACAGATCGTTGATCATGCTGTCCAGACGTTGCGCTTCGGTTTCAATACGCTCCAGTTCCTTGCTTTCACCGCTACGACGGCGCAGTAACGCCGTACCCAGTTGCAGACGCGTCAGCGGGGTGCGCAGCTCGTGAGAGATATCAGAAAGCAGACGCTGCTGAGAGGTCATCATGCGCTCCAGCGCGGTGACCATCTGGTTAAAACTGGCACCTGCGGCAAGGAATTCCTGTGGCCCCG > NC_000913/4104040‑4104338 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |