New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3675218 | 215 (1.900) | 14 (0.130) | 11/260 | NT | 6.2% | coding (433/1323 nt) | yhjE | putative transporter YhjE |
? | NC_000913 | = 3675243 | 222 (2.070) | coding (458/1323 nt) | yhjE | putative transporter YhjE |
GTAAAGCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3675063‑3675218 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggggcgTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCCCAT < NC_000913/3675243‑3675095 GTAAAGCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAAT < 2:472227/150‑1 AAGCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGTTGAATGGG < 2:494381/150‑1 AAGCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGG < 1:1691483/150‑1 AAGCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGG > 1:377340/1‑150 AGCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGG > 2:1885161/1‑150 AGCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGG > 1:20753/1‑150 GCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGC < 2:1828639/150‑1 GCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGC > 2:162212/1‑150 GCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGC < 1:424610/150‑1 GCGAAGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGACTGCTGCCGGGCTATGACACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGC > 2:1243409/1‑150 CGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCG < 2:1864997/150‑1 GTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGT > 2:675432/1‑150 CGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGC < 2:175674/150‑1 GGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCC < 2:222024/150‑1 ATTTCGACCGTGGTGATTGGGCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCA < 2:57405/150‑1 gTTCGCCCGTGGGGATTGGTCTGCTGCCGGGCTAGGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCGGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTCGGGCAGGGGCTGGGCGTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCAT < 1:1602490/149‑1 CGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCA < 2:636908/150‑1 CGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCA < 2:930628/150‑1 GACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCAC < 1:783232/150‑1 GACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCAC < 1:1242782/150‑1 GACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGGCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGTTTCAGTCCCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCAC < 1:1880267/150‑1 CCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTAGGCCACGATTGGTAGTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCGCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGGTAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCG < 1:1706074/150‑1 TGGTGATTGGTCTGATGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGAGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGACAGCAGCGACGCGCCGCCACATTCACCGacg > 2:336880/1‑147 GGTGATTGGGCTGCTGCCGGGCTCTGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCGGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGGCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTA < 1:336880/150‑1 TGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAG < 1:675432/150‑1 GGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCC < 2:210134/150‑1 GGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCC < 2:323974/150‑1 GGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCC < 1:1760798/150‑1 GGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCC > 1:1520453/1‑150 GGCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCC < 2:807813/150‑1 GCGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCCC < 2:545228/150‑1 CGTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCCCA < 2:615464/150‑1 GTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCCCAT > 2:1098505/1‑150 GTAAAGCGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3675063‑3675218 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggggcgTTTTCAGTCGCCAGCAGCGCCGCGCCGCCCCATTCACCGCCTAAGCCCAGACCCTGACCAAATCGAGCCAGCGCCAGCAGCAGCGGGGCGAAAATACCAATCGTGGCATAGCCCGGCAGCAGACCAATCACCACGGTCGAAATCCCCAT < NC_000913/3675243‑3675095 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |