New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3675218 | 215 (1.900) | 14 (0.130) | 11/260 | NT | 6.2% | coding (433/1323 nt) | yhjE | putative transporter YhjE |
? | NC_000913 | = 3675243 | 222 (2.070) | coding (458/1323 nt) | yhjE | putative transporter YhjE |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
CGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATG > NC_000913/3675069‑3675367 | gACGCTGGGCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGGCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGggcgg < 2:1285025/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGgcggcgcggc > 2:101266/1‑150 (MQ=255) cGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGttttcagtcgccagc < 2:175674‑M1/150‑16 (MQ=255) gTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGc < 1:1205917/150‑1 (MQ=255) gTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGGCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGGCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGc < 1:207584/150‑1 (MQ=255) tGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGCTGATTGGTCTGCTCCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGa > 2:36892/1‑150 (MQ=255) gCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGAc > 2:1640092/1‑150 (MQ=255) cTAAAGATGTGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTTCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACt > 2:295760/1‑150 (MQ=255) cGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGaaa > 1:1490148/1‑150 (MQ=255) cGATGCGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCGGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGaaa < 1:1782404/150‑1 (MQ=255) aTGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAc > 2:1098505‑M2/1‑149 (MQ=255) tGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAcg < 2:615464‑M2/150‑3 (MQ=255) ggggATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAcgc < 2:545228‑M2/150‑4 (MQ=255) gggATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAcgcc < 2:210134‑M2/150‑5 (MQ=255) gggATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAcgcc > 1:1520453‑M2/1‑146 (MQ=255) gggATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAcgcc < 1:1760798‑M2/150‑5 (MQ=255) tCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACcg > 1:1011044/1‑150 (MQ=255) tCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACcg > 1:1647215/1‑150 (MQ=255) 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tggtgATTGGTCTGATGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGAGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGttttcagtcgacagcagcgacgcgccgccacattcaccgacg > 2:336880‑M1/1‑108 (MQ=255) ggtgATTGGGCTGCTGCCGGGCTCTGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCGGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGGCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGttttcagtcgccagcagcgccgcgccgccccattcaccgccta < 1:336880‑M1/150‑44 (MQ=255) tgATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGttttcagtcgccagcagcgccgcgccgccccattcaccgcctaag < 1:675432‑M1/150‑46 (MQ=255) tgATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTg > 2:605095/1‑150 (MQ=255) gATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTTCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGc < 1:295760/150‑1 (MQ=255) gATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGc > 1:697238/1‑150 (MQ=255) gATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGc < 1:638166/150‑1 (MQ=255) aTTGGGCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGGCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCa < 1:1105744/150‑1 (MQ=255) gTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAAc < 1:1301962/141‑1 (MQ=255) tCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTa < 2:966356/150‑1 (MQ=255) ctgctgCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCCCCGCGCAAACGTGCACTGTAt > 1:259838/1‑150 (MQ=255) ctgctgCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTAt > 1:472889/1‑150 (MQ=255) ctgcCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGc < 2:835927/150‑1 (MQ=255) ctgcCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGc < 1:1460342/150‑1 (MQ=255) ccGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTcc < 1:1444039/150‑1 (MQ=255) 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cTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACt < 1:1058527/150‑1 (MQ=255) cGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACcga > 1:796551/1‑150 (MQ=255) ggTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACcgac > 2:351904/1‑150 (MQ=255) gTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAcgccccattcaccgcctaagcccagaccctgaccaaatcgagccagcgccagcagcagcggggcgaaaataccaatcgtggcatagcccggcagcagaccaatcaccacggtc < 1:1242782‑M2/150‑114 (MQ=255) aaTGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTtg < 2:1454200/122‑1 (MQ=255) aaTGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGc < 2:187326/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAcgccccattcaccgcctacgcccagcccctgcccgaatcgagccagcgccagcagccgcggggcgaaaataccaatcgtggcctagcccggcagcagaccaatccccacgggcgaac < 1:1602490‑M2/150‑118 (MQ=255) tGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAg > 2:1509667/1‑150 (MQ=255) ggggCGGCGCGGCGCTGCTGGCGCCTGAAAACGCCCCACCGCCCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTATCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGCCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGt > 2:292564/1‑150 (MQ=255) gggCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAAcgccccattcaccgcctaagcccagaccctgaccaaatcgagccagcgccagcagcagcggggcgaaaataccaatcgtggcatagcccggcagcagaccaatcaccacggtcgaaatcc < 2:222024‑M2/150‑121 (MQ=255) ggcggcGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGttt > 2:466249/1‑150 (MQ=255) ggCGttttcagtcgccagcagcgccgcgccgccccattcaccgcctaagcccagaccctgaccaaatcgagccagcgccagcagcagcggggcgaaaataccaatcgtggcatagcccggcagcagaccaatcaccacggtcgaaatccc < 2:807813‑M1/150‑147 (MQ=255) gcggcgcggcGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTa < 1:1942125/150‑1 (MQ=255) ggcgcggcgcTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATg < 2:1627253/150‑1 (MQ=255) | CGACGCTGGTCGCCTCGTTGCTAACGATGGGGATTTCGACCGTGGTGATTGGTCTGCTGCCGGGCTATGCCACGATTGGTATTTTCGCCCCGCTGCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATG > NC_000913/3675069‑3675367 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |