| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 313592 = | 100 (0.880) | 6 (0.060) | 5/262 | NT | 5.9% | intergenic (‑350/+124) | ykgR/ykgP | putative membrane protein YkgR/putative oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | 313630 = | 96 (0.890) | intergenic (‑388/+86) | ykgR/ykgP | putative membrane protein YkgR/putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TCCGGGCGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCA > NC_000913/313443‑313740 | tCCGGGCGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTac < 2:1077099/150‑1 (MQ=255) ataaactatgggatcaaattcagtcatcgaaaggaactggcttgtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCa > 1:1097411‑M1/149‑150 (MQ=255) taaactatgggatcaaattcaggcatcgaaaggaactggctggtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCAc < 1:113483‑M1/3‑1 (MQ=255) taaactatgggatcaaattcaggcatcgaaaggaactggctggtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCAc < 1:1499083‑M1/3‑1 (MQ=255) aactatgggatcaaattcaggcatcgaaaggaactggctggtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCACTg < 1:1168226‑M1/5‑1 (MQ=255) aactatgggatcaaattcaggcatcgaaaggaactggctggtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCACTg < 2:569448‑M1/5‑1 (MQ=255) ctatgggatcaaattcaggcatcgaaaggaactggctggtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCACTGCa < 1:604099‑M1/7‑1 (MQ=255) cGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCa > 1:592499/1‑150 (MQ=255) cGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCa < 2:407347/150‑1 (MQ=255) gTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAg < 2:1743057/150‑1 (MQ=255) ttGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAgg < 2:230981/150‑1 (MQ=255) gATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCa > 1:567810/1‑150 (MQ=255) ttGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACg < 2:1785/150‑1 (MQ=255) 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agGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCAttgatttg < 2:1300612/144‑1 (MQ=255) gAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGtt > 1:1819775/1‑129 (MQ=255) gAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGtt < 2:1819775/129‑1 (MQ=255) aTTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTAc < 1:716551/150‑1 (MQ=255) cactacccgataccgccacacaacttctctcacatacttaacccgtCCCTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTCCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTAct > 1:1359903‑M1/47‑150 (MQ=255) aTTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCCGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGgaga > 2:1418395/1‑150 (MQ=255) aTTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGgaga > 1:1225396/1‑150 (MQ=255) aTTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGgaga > 1:1808743/1‑150 (MQ=255) aTTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGgaga > 1:1982743/1‑150 (MQ=255) aaCCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGaataa < 2:129203/150‑1 (MQ=255) cGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAg < 2:241829/150‑1 (MQ=255) 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acacTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATATGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAAccagcca > 1:1704869/1‑150 (MQ=255) | TCCGGGCGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCA > NC_000913/313443‑313740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |