| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 313592 = | 100 (0.880) | 6 (0.060) | 5/262 | NT | 5.9% | intergenic (‑350/+124) | ykgR/ykgP | putative membrane protein YkgR/putative oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | 313630 = | 96 (0.890) | intergenic (‑388/+86) | ykgR/ykgP | putative membrane protein YkgR/putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
ATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTAT > NC_000913/313485‑313777 | tggtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACggg > 1:1537875‑M1/108‑150 (MQ=255)atAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACggg < 2:753917/150‑1 (MQ=255) tAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGt > 2:1499083/1‑150 (MQ=255) ggtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtanaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGt > 1:1852272‑M1/107‑150 (MQ=255) ggtttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcaaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGt > 1:1859234‑M1/107‑150 (MQ=255) aaTGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAAGCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGtt < 2:1754732/150‑1 (MQ=255) ttccgttaatggattaaatatctattattctcccgagagtaaaactatcgaatcaatgagtaaccgatacagcctcacaaattctttcagataattaacccgtCACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTaa > 2:134976‑M1/104‑150 (MQ=255) cGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTa < 1:18770/150‑1 (MQ=255) cGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTa < 1:1389692/150‑1 (MQ=255) gTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTAt > 2:466205/1‑150 (MQ=255) ctATCTCCTTGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTAt > 2:428364/2‑150 (MQ=255) tATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATc < 2:1625567/150‑1 (MQ=255) aTCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCt < 2:1224528/150‑1 (MQ=255) tctcCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTg < 2:408606/150‑1 (MQ=255) tctcCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTg > 1:1166573/1‑150 (MQ=255) ctcCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACggg > 2:1660821/1‑138 (MQ=255) ctcCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAAtt < 2:1992727/144‑1 (MQ=255) ctcCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAAtt > 1:1992727/1‑144 (MQ=255) ttATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTtgtg < 2:1053599/150‑1 (MQ=255) ttATACAAGATATCGTTGTTGGCGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTtgtg < 2:1362029/150‑1 (MQ=255) tataCAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGa > 2:68369/1‑150 (MQ=255) tataCAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGa > 2:1346159/1‑150 (MQ=255) ataCAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAg < 1:1688570/150‑1 (MQ=255) 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gagaACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAAttt < 2:1107672/150‑1 (MQ=255) gaACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGa > 1:1213533/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATcc < 2:34837/150‑1 (MQ=255) cGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATcc > 1:1680020/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATccc < 1:1841827/150‑1 (MQ=255) tGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCa < 2:355657/150‑1 (MQ=255) tGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCa < 2:343647/150‑1 (MQ=255) gCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATACCaa > 1:558293/1‑149 (MQ=255) cGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAg < 2:1166573/150‑1 (MQ=255) cagtgACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGtt < 2:569448‑M2/145‑1 (MQ=255) cagtgACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGtt < 1:1168226‑M2/145‑1 (MQ=255) tgACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACAAGCCAGTTCCTTTCGATGACTGAATTTGATCCCATAGTTTAt > 1:1097411‑M2/3‑150 (MQ=255) | ATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTAT > NC_000913/313485‑313777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |