New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 415397 = | 78 (0.690) | 4 (0.040) | 4/266 | NT | 5.1% | coding (357/3147 nt) | sbcC | ATP dependent, structure specific DNA nuclease ‑ SbcC subunit |
? | NC_000913 | 415428 = | 72 (0.660) | coding (326/3147 nt) | sbcC | ATP dependent, structure specific DNA nuclease ‑ SbcC subunit |
CGTTCTTTGGGTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAG > NC_000913/415248‑415543 | cgtctctctaacgtttcacaatcgcaaaatgatctcatgacccgcgataccgccgaatgtctggcggaggtggagtttgaagtgaaaggtgaagcgtaccgtgcattctggagccagaatcgggcgcgtaaccaacccgacggtaatttg < 2:991925‑M1/1‑1 (MQ=255) cgTTCTTTGGGTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGgcg > 2:786861/1‑150 (MQ=255) gtctctctaacgtttcacaatcgcaaaatgatctcatgacccgcgataccgccgaatgtctggcggaggtggagtttgaagtgaaaggtgaagcgtaccgtgcattctggagccagaatcgggcgcgtaaccaacccgacggtaatttGc < 2:66637‑M1/2‑1 (MQ=255) gtctctctaacgtttcacaatcgcaaaatgatctcatgacccgcgataccgccgaatgtctggcggaggtggagtttgaagtgaaaggtgaagcgtaccgtgcattctggagccagaatcgggcgcgtaaccaacccgacggtaatttGc > 1:975131‑M1/149‑150 (MQ=255) cTTTGGGTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTGATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAgc > 2:730655/1‑150 (MQ=255) cTTTGGGTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAgc > 1:301832/1‑150 (MQ=255) cTTTGGGTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAgc > 2:1042726/1‑150 (MQ=255) tGGGTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAgcgcg < 1:142263/150‑1 (MQ=255) tGGGTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAgcgcg > 2:380040/1‑150 (MQ=255) gggTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGGCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAgcgcgc < 1:1453786/150‑1 (MQ=255) ggTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGcc > 1:1648587/1‑150 (MQ=255) gTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCa > 1:242515/1‑150 (MQ=255) ggCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGctc < 1:636514/150‑1 (MQ=255) gCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGctct > 1:1854023/1‑150 (MQ=255) cATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTa > 2:538882/1‑150 (MQ=255) ggAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTg > 2:305034/1‑150 (MQ=255) ggAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTg < 2:406573/150‑1 (MQ=255) gAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTgg < 1:1680099/150‑1 (MQ=255) 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ccAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACt < 1:1280854/150‑1 (MQ=255) aGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTcc < 2:1648587/150‑1 (MQ=255) gCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCa < 1:1798979/150‑1 (MQ=255) cTTTCAATTAGTCAAAGAGAATTTTACCGTCTACGAATCGCGCCACCACTACTCATTTCACCTACAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCg > 2:533379/1‑150 (MQ=255) tCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCa < 1:127577/150‑1 (MQ=255) cACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAg > 2:1483119/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAACCTCCACCTCCGCCAGACATTc > 1:668428/1‑150 (MQ=255) gCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTcggcg < 1:1483119/150‑1 (MQ=255) gagaATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGt > 2:1128957/1‑150 (MQ=255) aTTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATcg < 1:348052/150‑1 (MQ=255) aTTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATcg < 1:328782/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCggg > 1:1432321/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCCCGGTACGCTTCACCTTTCACTTCACACTCCACCTCCGCCAGACCTTCGGCGGTATCGCGGGt > 2:1016788/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCa > 1:871215/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATg < 1:541246/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATg < 2:756411/150‑1 (MQ=255) gcGGCGCAGCGCGCCAGCGCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGGGCCCGATTGTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGGCATg < 2:1523664/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGTGGGTCATgag < 1:771612/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTGCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATgag > 2:1083215/1‑150 (MQ=255) | CGTTCTTTGGGTTTGGCATTCAGGAAGGCAGCAAATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAG > NC_000913/415248‑415543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |