| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 415397 = | 78 (0.690) | 4 (0.040) | 4/266 | NT | 5.1% | coding (357/3147 nt) | sbcC | ATP dependent, structure specific DNA nuclease ‑ SbcC subunit |
| ? | NC_000913 | 415428 = | 72 (0.660) | coding (326/3147 nt) | sbcC | ATP dependent, structure specific DNA nuclease ‑ SbcC subunit | |||||
AATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGTTAGAGAGACG > NC_000913/415281‑415576 | aaTTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCaaa > 1:539851/1‑150 (MQ=255) atgacccgcgataccgccgaatgtctggcggaggtggagtttgaagtgaaaggtgaagcgtaccgtgcattctggagccagaatcgggcgcgtaaccaacccgacggtaatttGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTa > 2:688196‑M1/114‑150 (MQ=255) tgacccgcgataccgccgaatgtctggcggaggtggagtttgaagtgaaaggtgaagcgtaccgtgcattctggagccagaatcgggcgcgtaaccaacccgacggtaatttGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTAc > 1:570949‑M1/113‑150 (MQ=255) gacccgcgataccgccgaatgtctggcggaggtggagtttgaagtgaaaggtgaagcgtaccgtgcattctggagccagaatcgggcgcgtaaccaacccgacggtaatttGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTAcc > 1:1751499‑M1/112‑150 (MQ=255) cccTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCCCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCg > 2:1528192/1‑150 (MQ=255) cTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTc > 2:1798979/1‑150 (MQ=255) tGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCg > 1:66637/1‑150 (MQ=255) gCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCgg > 1:880356/1‑150 (MQ=255) gCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCgg > 2:541246/1‑150 (MQ=255) gAAAGCAGCATCGAACGGATGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGggt > 1:991925/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGggttg > 1:1772802/1‑150 (MQ=255) agcagcATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGggttgg < 1:85194/150‑1 (MQ=255) gcagcaTCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGggttggt < 2:142092/150‑1 (MQ=255) cagcaTCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGggttggtt > 1:1151561/1‑150 (MQ=255) gcaTCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTAc > 2:348052/1‑150 (MQ=255) tCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTAcgcg < 1:1629163/150‑1 (MQ=255) tCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTAcgcg < 2:1754515/150‑1 (MQ=255) tCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTAcgcg < 2:1222627/150‑1 (MQ=255) 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gggTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGAt < 2:1211531/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGAtt > 2:127577/1‑150 (MQ=255) agTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGAtt > 1:273973/2‑150 (MQ=255) gAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTg < 2:1066637/150‑1 (MQ=255) gAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTg < 1:1718196/150‑1 (MQ=255) 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gTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGaa < 1:339069/150‑1 (MQ=255) aaTCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATg < 2:1289909/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGc < 1:1414667/150‑1 (MQ=255) tCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGAGCCAGAAtcgg < 2:301832/150‑4 (MQ=255) ccAGCCCGTTTAACGTCGCTGTCAGTTACAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTAACGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCAc > 2:1710073/1‑150 (MQ=255) 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tGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGtt > 1:1969947/1‑150 (MQ=255) ggCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGATTGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCTGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGTTa < 2:1448617/150‑1 (MQ=255) ggCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGtt < 1:1098415/149‑1 (MQ=255) ggCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGtt > 2:1098415/1‑149 (MQ=255) ccTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGTTagaga < 2:1432321/150‑1 (MQ=255) ccTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGTTagaga > 1:1589353/1‑150 (MQ=255) gcAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGTTAGAGAGAc < 2:66637‑M2/148‑1 (MQ=255) gcAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGTTAGAGAGAc > 1:975131‑M2/3‑150 (MQ=255) cAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGTTAGAGAGACg < 2:991925‑M2/149‑1 (MQ=255) | AATTGCCCCTGCGAAAGCAGCATCGAACGGGTGAAGCGCCCGTAATCCAGCCCGGTTAACGTCGCTGTCAGTTCCAGCTTATCTTTCACTTTGTCGGCGAGAATTTTGCCGTCGGCGCAGCGCGCCAGCTCTACGCGTGGCACCTGCAAATTACCGTCGGGTTGGTTACGCGCCCGATTCTGGCTCCAGAATGCACGGTACGCTTCACCTTTCACTTCAAACTCCACCTCCGCCAGACATTCGGCGGTATCGCGGGTCATGAGATCATTTTGCGATTGTGAAACGTTAGAGAGACG > NC_000913/415281‑415576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |