New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1662730 = | 77 (0.680) | 5 (0.050) | 5/260 | NT | 6.8% | coding (2175/2424 nt) | ynfF | putative selenate reductase YnfF |
? | NC_000913 | 1662753 = | 63 (0.590) | coding (2198/2424 nt) | ynfF | putative selenate reductase YnfF |
GGGACGATCCCCTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCGGGCAAGGTGCGTGGCTTAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTC > NC_000913/1662582‑1662877 | gggACGATCCCCTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCAcgcg < 2:831472/150‑1 (MQ=255) attgatactgccgccgtgatcgacccggtcaccaaacatatccgctttaagccacgcaccttgcccgatggcggtaacgccaggcagaatacgcggagtcacttttgcggcaatcagcatttctccattattgttaaatacccgcaCGGt > 2:555339‑M1/147‑150 (MQ=255) cGATCCCCTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGCATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTAt > 1:135908/1‑150 (MQ=255) gATCCCCTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATc < 1:441326/150‑1 (MQ=255) atacccTGCGGAAAACCTATCCACTGCATTTAACGGGCTTCCATTAAAATTCGCGTACCAACTCCAGCTAAGTCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTTCCCACAATATGTTTGGATCAACCCCATTGATGATAAGGCACGCGGTAtac < 2:864892/147‑3 (MQ=255) aTCCCCTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATcc > 1:851524/1‑150 (MQ=255) ccccTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGt > 2:463673/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCa < 1:102337/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCa > 1:446004/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCa < 1:1863879/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGAAAACCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCa > 1:1845128/1‑150 (MQ=255) aaaCCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTAGCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATCTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTCTGGATCAACCCCATTGATCCTCAGGCACGCTGTATCCGTCATGGCGATa < 1:680563/150‑1 (MQ=255) aaCCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATAc < 1:331763/150‑1 (MQ=255) aCCTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATAACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTTATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATAcc > 1:1206005/1‑150 (MQ=255) tcgacccggtcaccaaacatatccgctttaagccacgcaccttgcccgatggcggtaacgccaggcagaatacgcggagtcacttttgcggcaatcagcatttctccattattgttaaatacccgcaCGGTATCCGTCATGGCGATACCg > 1:1917545‑M1/128‑150 (MQ=255) ccTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACTCGGTATCCGTCATGGCGATACCg > 1:1497337/1‑150 (MQ=255) ccTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCg > 1:1837200/1‑150 (MQ=255) cTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGt > 1:1999508/1‑150 (MQ=255) 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gCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATg > 1:1615021/1‑150 (MQ=255) tCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGgag > 2:14992/1‑150 (MQ=255) aTTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGaaa > 2:1444195/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCt > 1:499005/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCt > 1:506249/1‑150 (MQ=255) gcgcGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGAtt < 2:989500/150‑1 (MQ=255) ccttgcccgatggcggtaacgccaggcagaatacgcggagtcacttttgcggcaatcagcatttctccattattgttaaatacccgcaCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCg > 2:307857‑M1/89‑150 (MQ=255) cccACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCaa > 1:653999/1‑150 (MQ=255) cccACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCaa > 1:660563/1‑150 (MQ=255) cccACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCaa > 1:1571777/1‑150 (MQ=255) cccACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCaa > 1:1660991/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTg < 1:1498073/150‑1 (MQ=255) cAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGGGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGAc < 2:877317/150‑1 (MQ=255) aCGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCcgc > 2:1208354/1‑150 (MQ=255) gCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTa > 1:581794/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |