| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1662730 = | 77 (0.680) | 5 (0.050) | 5/260 | NT | 6.8% | coding (2175/2424 nt) | ynfF | putative selenate reductase YnfF |
| ? | NC_000913 | 1662753 = | 63 (0.590) | coding (2198/2424 nt) | ynfF | putative selenate reductase YnfF | |||||
CTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCGGGCAAGGTGCGTGGCTTAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTC > NC_000913/1662604‑1662902 | cTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGt > 1:1999508/1‑150 (MQ=255) aTCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGc > 1:661429/1‑150 (MQ=255) tCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCg < 1:736027/150‑1 (MQ=255) ccggtcaccaaacatatccgctttaagccacgcaccttgcccgatggcggtaacgccaggcagaatacgcggagtcacttttgcggcaatcagcatttctccattattgttaaatacccgcaCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCgg > 1:832392‑M1/123‑150 (MQ=255) aGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTa < 2:1905252/150‑1 (MQ=255) aCGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACaat > 1:479928/1‑150 (MQ=255) gCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATg > 1:1615021/1‑150 (MQ=255) tCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGgag > 2:14992/1‑150 (MQ=255) aTTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGaaa > 2:1444195/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCt > 1:506249/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCt > 1:499005/1‑150 (MQ=255) gcgcGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGAtt < 2:989500/150‑1 (MQ=255) ccttgcccgatggcggtaacgccaggcagaatacgcggagtcacttttgcggcaatcagcatttctccattattgttaaatacccgcaCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCg > 2:307857‑M1/89‑150 (MQ=255) cccACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCaa > 1:1660991/1‑150 (MQ=255) cccACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCaa > 1:660563/1‑150 (MQ=255) cccACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCaa > 1:1571777/1‑150 (MQ=255) cccACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCaa > 1:653999/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTg < 1:1498073/150‑1 (MQ=255) cAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGGGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGAc < 2:877317/150‑1 (MQ=255) aCGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCcgc > 2:1208354/1‑150 (MQ=255) gCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTa < 1:1444195/150‑1 (MQ=255) gCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTa > 1:581794/1‑150 (MQ=255) cAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTAt > 2:807167/1‑150 (MQ=255) cAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTAt < 2:1681527/150‑1 (MQ=255) cAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTAt < 1:248250/150‑1 (MQ=255) atatTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTc < 1:1780639/150‑1 (MQ=255) atTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTg > 2:320036/1‑150 (MQ=255) ggcagaatacgcggagtcacttttgcggcaatcagcatttctccattattgttaaatacccgcaCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGc > 1:1796171‑M1/65‑90 (MQ=255) ggcagaatacgcggagtcacttttgcggcaatcagcatttctccattattgttaaatacccgcaCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGc < 2:1796171‑M1/26‑1 (MQ=255) gATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCt < 2:1845128/150‑1 (MQ=255) aTGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTg < 1:552263/150‑1 (MQ=255) gtTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGt > 1:966973/1‑150 (MQ=255) cagcagGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATTGAGAAATGCTGATTGcc < 1:33948/114‑1 (MQ=255) cagcagGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGcc > 2:33948/1‑114 (MQ=255) cagcagGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGAGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGAGTATTCTGCCTGGCGTTAcc > 2:1217815/1‑150 (MQ=255) gcagGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGc > 1:188046/1‑150 (MQ=255) gcagGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGc < 1:807167/150‑1 (MQ=255) cagGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGcc > 2:413842/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATc < 2:1554724/150‑1 (MQ=255) tGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCggg > 1:1131513/1‑150 (MQ=255) gCCCACAAGCGGTGGGGAGCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTAGCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCGGATTGCCGCAAAAGGGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGGTAACGCCaggcaga < 1:643628/150‑7 (MQ=255) gCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCGGGc > 1:200069/1‑150 (MQ=255) cccACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCGGGCa < 2:479928/150‑1 (MQ=255) ccACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCGGGCaa < 2:661429/150‑1 (MQ=255) cggcaatcagcatttctccattattgttaaatacccgcacggtatcgccatgacggataccgTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCGGGCAAgg > 2:307857‑M2/63‑150 (MQ=255) 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tGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCGGGCAAGGTGCGTGGCTTAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTc < 2:1615021/150‑1 (MQ=255) | CTATCCACTGCAGTTAACGGGCTTCCATTACAAAGCGCGTACCCACTCCAGCTACGGCAATATTGATGTGTTACAGCAGGCCTGCCCACAAGAGGTGTGGATCAACCCCATTGATGCTCAGGCACGCGGTATCCGTCATGGCGATACCGTGCGGGTATTTAACAATAATGGAGAAATGCTGATTGCCGCAAAAGTGACTCCGCGTATTCTGCCTGGCGTTACCGCCATCGGGCAAGGTGCGTGGCTTAAAGCGGATATGTTTGGTGACCGGGTCGATCACGGCGGCAGTATCAATATTC > NC_000913/1662604‑1662902 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |