| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3275702 | 79 (0.700) | 6 (0.060) | 5/262 | NT | 7.1% | coding (421/1572 nt) | garD | galactarate dehydratase |
| ? | NC_000913 | = 3275723 | 81 (0.750) | coding (442/1572 nt) | garD | galactarate dehydratase | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTA > NC_000913/3275555‑3275851 | gTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGc > 2:1572005/1‑150 (MQ=255) tactacCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCg > 1:1306733/1‑150 (MQ=255) ctacCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTc > 1:1117983/1‑150 (MQ=255) ggAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAcgcctgccac > 2:361097‑M1/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACtgtgtg < 1:1111954/150‑1 (MQ=255) gccgccGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGc > 2:312445/1‑150 (MQ=255) gccgccGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGc > 2:1438073/1‑150 (MQ=255) gccgccGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGc < 2:803544/150‑1 (MQ=255) ccgccgTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCa < 1:1572005/150‑1 (MQ=255) cgccgTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAg > 2:534311/1‑150 (MQ=255) gccgTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCGGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAgg < 1:1774838/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAcgcctgccacacagtggacgctggtggtga < 1:361097‑M1/150‑31 (MQ=255) cGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACt > 1:1226226/1‑150 (MQ=255) cTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTAT‑‑‑CACCAcgcctgccacacagtggacgctggtggtgataccg < 1:1199330‑M1/150‑36 (MQ=255) tGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATg < 1:1438073/150‑1 (MQ=255) ggcCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAcgcctgccacacagtggacgctggtggtgatac < 1:1314665‑M1/149‑34 (MQ=255) gCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGTTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGTCAGGCGTGGTGGAGTATgt < 2:716344/150‑1 (MQ=255) gCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATgt > 1:1977470/1‑150 (MQ=255) 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ccTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTaa > 2:259477/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTaa > 2:1374889/1‑150 (MQ=255) cTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCa < 1:492805/150‑1 (MQ=255) cGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGtggtgataccgagcaggtttttggtgcccacgctgccatcggcattgcgatagccctcaaaggtgtatccttccagcggcggtaagggttccgggactttggttgccagtggcag < 1:1199330‑M2/150‑116 (MQ=255) cGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCAcc > 2:920821/1‑150 (MQ=255) cGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCAcc < 1:1475626/150‑1 (MQ=255) gTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGtggtggtgataccgagcaggtttttggtgcccacgctgccatcggcattgcgatagccctcaaaggtgtatccttccagcggcggtaagggttccgggactttggttgccagtggcc < 1:1314665‑M2/150‑118 (MQ=255) tCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGtggtggtgataccgagcaggtttttggtgcccacgctgccatcggcattgcgatagccctcaaaggtgtatccttccagcggcggtaagggttccgggactttggttgccagtggcagcg < 1:361097‑M2/150‑121 (MQ=255) caccacCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCggcggc < 1:878082/150‑1 (MQ=255) caccaGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGt < 2:1244327/150‑1 (MQ=255) acgcctgccacacagtggacgctggtggtgataccgagcaggtttttggtgcccacgctgccatcggcattgcgatagccctcaaaggtgtatccttccagcggcggtaagggttccgggactttggttgccagtgg > 1:1514709‑M1/1‑1 (MQ=255) acgcctgccacacagtggacgctggtggtgataccgagcaggtttttggtgcccacgctgccatcggcattgcgatagccctcaaaggtgtatccttccagcggcggtaagggttccgggactttggttgccagtgg < 2:1514709‑M1/137‑137 (MQ=255) aGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTa < 2:604851/150‑1 (MQ=255) aGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGGTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTa < 2:611610/150‑1 (MQ=255) aGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGGGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGAGCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCGGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTa < 2:611606/150‑1 (MQ=255) | GTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTA > NC_000913/3275555‑3275851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |