| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3275702 | 79 (0.700) | 6 (0.060) | 5/262 | NT | 7.1% | coding (421/1572 nt) | garD | galactarate dehydratase |
| ? | NC_000913 | = 3275723 | 81 (0.750) | coding (442/1572 nt) | garD | galactarate dehydratase | |||||
CGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTACCATTCACAAT > NC_000913/3275583‑3275872 | cGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACt > 1:1226226/1‑150 (MQ=255) tGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATg < 1:1438073/150‑1 (MQ=255) gCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGTTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGTCAGGCGTGGTGGAGTATgt < 2:716344/150‑1 (MQ=255) gCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATgt > 1:1977470/1‑150 (MQ=255) gCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGACGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATgt < 1:992320/150‑1 (MQ=255) ccACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGt > 1:1514709‑M2/1‑136 (MQ=255) ccACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGt < 2:1514709‑M2/137‑2 (MQ=255) cTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGGACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATgtagta > 1:337049/1‑150 (MQ=255) gCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTCGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTaaaa < 1:1035019/150‑1 (MQ=255) cAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTaaaaa > 2:1281945/1‑150 (MQ=255) aaaGTCCCTGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTTGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCAtt < 2:1117983/150‑1 (MQ=255) aaaGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCAtt > 1:1160423/1‑150 (MQ=255) aaGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACGCCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTTGACTATGTAGTAAAAATCATTg < 2:1860106/150‑1 (MQ=255) gTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGaa > 1:406836/1‑150 (MQ=255) tCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAAc > 2:1648224/1‑150 (MQ=255) cccGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAAcg > 2:909138/1‑150 (MQ=255) ccGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAAcgc > 1:1733581/1‑150 (MQ=255) cGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAAcgcg > 2:273980/1‑150 (MQ=255) 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gTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGtggtggtgataccgagcaggtttttggtgcccacgctgccatcggcattgcgatagccctcaaaggtgtatccttccagcggcggtaagggttccgggactttggttgccagtggcc < 1:1314665‑M2/150‑118 (MQ=255) tATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACcggc > 2:986018/1‑150 (MQ=255) tCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGtggtggtgataccgagcaggtttttggtgcccacgctgccatcggcattgcgatagccctcaaaggtgtatccttccagcggcggtaagggttccgggactttggttgccagtggcagcg < 1:361097‑M2/150‑121 (MQ=255) caccacCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCggcggc < 1:878082/150‑1 (MQ=255) caccaGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGt < 2:1244327/150‑1 (MQ=255) aGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTa < 2:604851/150‑1 (MQ=255) aGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGGTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTa < 2:611610/150‑1 (MQ=255) aGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGGGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGAGCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCGGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTa < 2:611606/150‑1 (MQ=255) cGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTAcc < 1:1281945/150‑1 (MQ=255) ccACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCCACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTAt > 2:172599/1‑150 (MQ=255) gtgtgGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTa < 2:1733581/150‑1 (MQ=255) gtgtgGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTa < 1:1059152/150‑1 (MQ=255) gtgGCAGGCGtggtggtgataccgagcaggtttttggtgcccacgctgccatcggcattgcgatagccctcaaaggtgtatccttccagcggcggtaagggttccgggactttggttgccagtggcagcgtgtgtaacggcggcgcttcc > 2:361097‑M2/1‑10 (MQ=255) cAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTACCAtta > 2:516539/1‑149 (MQ=255) cAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTACCATTc < 1:602905/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCAATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTACCATTcac < 2:1947589/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGACTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTACCATTcaca < 2:97721/150‑1 (MQ=255) gtggtgGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTACCATTCACAat > 1:1510667/1‑150 (MQ=255) | CGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCATTGAACGCGATCTGCTACCGAAATACCCGAACGTCGATGGCGTGGTGGGGCTGAATCATTTGTACGGTTGTGGCGTGGCGATTAACGCACCGGCGGCAGTTGTACCTATCCGTACCATTCACAAT > NC_000913/3275583‑3275872 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |