| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
CATACTGGCAAGAATGCCAGCAATGACCGGAGCCGCTAAATCATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCAC > NC_000913/3700010‑3700308 | gaaggcatcgcgcaatgaggaagattgccgggtgctgacagtaaaaagcaatcgtagaatcagcggcaagccggaaaggttccggtgaggcgcaatgttgcgggggctttatccctggtggcattggttgctggagagagaaaaCCCCCg > 2:237016‑M1/145‑150 (MQ=255) ggCAAGAATGCCAGCAATGACCGGAGCCGCTAAATCATGCCAGAAGGACATGCGCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTTAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGgtgt < 1:396723/150‑1 (MQ=255) aGAATGCCAGCAATGACCGGAGCCGCTAAATCATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTc < 2:907436/150‑1 (MQ=255) 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cAATGACCGGAGCCACTAAATCATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATAc > 2:1542012/1‑150 (MQ=255) aaTGACCGGAGCCGCTAAATCATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATAcc < 1:784715/150‑1 (MQ=255) aaTGACCGGAGCCGCTAAATCATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATAcc < 1:720427/150‑1 (MQ=255) aCCGGAGCCGCTAAATCATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCa > 1:1624377/1‑150 (MQ=255) ccGGAGCCGCTAAATCATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCaa < 1:554150/150‑1 (MQ=255) 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gATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCttttt < 2:1231061/150‑1 (MQ=255) aTTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttctggcatga < 2:1914077‑M2/150‑110 (MQ=255) aGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcgggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttctggcatgatt > 2:1189116‑M2/1‑38 (MQ=255) gCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcgggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttctggcatgattt < 2:665057‑M2/150‑114 (MQ=255) gCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcgggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttc < 1:472790‑M2/139‑103 (MQ=255) gCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcgggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttc > 2:472790‑M2/1‑37 (MQ=255) gCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcgggggctaatcttgactctagaccactaaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttctggcatgattt < 2:671847‑M2/150‑114 (MQ=255) gCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGt > 1:928605/1‑150 (MQ=255) cccccGcacgttgcaggtatgcacctgacaacaccacgggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttctggcatgattta > 1:763375‑M1/1‑6 (MQ=255) CCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTc > 1:1141916‑M1/1‑150 (MQ=255) cccGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcgggggttaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagatgggcatggccttctggcatgattt < 1:1887323‑M2/147‑114 (MQ=255) cccGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcgggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttc > 2:695764‑M2/1‑34 (MQ=255) ccGcacgttgcaggtatgcacctgacaacaccacgggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttctggcatgatttagcg < 2:1642186‑M1/150‑148 (MQ=255) ccGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGcgggggctaatcttgactctagaccactcaagaatagccgcgaaacgttgtcattacaacacaggcggctatatgacgttcgcagagctgggcatggccttctggcatgatttagcg < 1:1299878‑M2/150‑118 (MQ=255) | CATACTGGCAAGAATGCCAGCAATGACCGGAGCCGCTAAATCATGCCAGAAGGCCATGCCCAGCTCTGCGAACGTCATATAGCCGCCTGTGTTGTAATGACAACGTTTCGCGGCTATTCTTGAGTGGTCTAGAGTCAAGATTAGCCCCCGTGGTGTTGTCAGGTGCATACCTGCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTCTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGAACCTTTCCGGCTTGCCGCTGATTCTACGATTGCTTTTTACTGTCAGCAC > NC_000913/3700010‑3700308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |