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tGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTa < 2:1018495/133‑1 (MQ=31) tGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAT‑AGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCAGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCg < 1:1236914/150‑1 (MQ=9) tGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATAGCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTa > 1:1018495/1‑133 (MQ=14) gTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCg < 1:307596/150‑1 (MQ=11) gTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCg < 2:137048/150‑1 (MQ=11) gTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCg > 2:373231/1‑150 (MQ=11) gCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAtaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctacaagggaccatcaaatccctgcagcactccttacg < 1:279760‑M2/112‑77 (MQ=255) gCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAtaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctacaagggaccatcaaatccctgcagcactccttacg > 2:279760‑M2/1‑36 (MQ=255) aCCAATATCACTTAAAtaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctacaagggaccatcaaatccctgcagcactccttacgtcagttatcccgcatcaccctgtgagtacaggattttttatgaggttacttttttatt < 1:1610279‑M2/150‑135 (MQ=255) cAATATCACTTAAAtaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctacaagggaccatcaaatccctgcagcactccttacgtcagttatcccgcatcaccctgtgagtacaggattttttatgaggttacttttttattga < 2:670911‑M2/150‑137 (MQ=255) aaTATCACTTAAAtaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctacaagggaacatcaaatacatgcagcactccttaagtaagttatcccgcatcaccctgtgagtacaggattttttatgaggttacttttttattgaa < 2:1454745‑M2/150‑138 (MQ=255) | TTTATATACATTCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGTCCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGAT > NC_000913/4498075‑4498360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |