New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3869215 | 122 (1.570) | coding (95/1248 nt) | yidR | DUF3748 domain‑containing galacturonate catabolism protein YidR |
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TGGATGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAG > NC_000913/3869038‑3869336 | tGGATGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGC < 1:1136391‑M1/150‑1 (MQ=255) tGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGt > 2:915750/1‑150 (MQ=255) tGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGt > 1:995447/1‑150 (MQ=255) aaaaCATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCa > 1:571081/1‑150 (MQ=255) aaaCATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCaa > 1:1205593/1‑150 (MQ=255) aCATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAAt > 1:307920/1‑150 (MQ=255) tatTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATAcc < 1:277140/150‑1 (MQ=255) atTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCa > 1:397344/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) acgCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTcaca < 2:1006936/150‑1 (MQ=255) cgcCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAgg > 2:648823/1‑150 (MQ=255) gcCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGa > 2:1223344/1‑150 (MQ=255) ccAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGAc > 1:233925/1‑150 (MQ=255) aGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtg < 2:275569‑M2/150‑113 (MQ=255) aGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtccttctggcgcgtagtttaccggcgagaccattgagagtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttttctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtg < 2:588737‑M2/150‑113 (MQ=255) aGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACtt > 1:1199262/1‑150 (MQ=255) aaGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgac < 1:466929‑M2/150‑115 (MQ=255) ggACGCccgacagccagtggctggtatttgacgtgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgaccg < 1:1164732‑M1/150‑145 (MQ=255) ggACGCccgacagccagtggctggtatttgacgtgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgaccg < 2:449905‑M1/150‑145 (MQ=255) ggACGCccgacagccagtggctggtatttgacgtgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgaccg > 2:979886‑M1/1‑6 (MQ=255) ggACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtccttctggcgcgtcgtttaccggcgagaccattgagcgtgtgaatatccataccggcgaggtcgaggttatctatcgcgcgtcacagggcgcacacgtcggcgtggtgaccg < 1:949653‑M2/150‑117 (MQ=255) cGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTc < 2:806251/150‑1 (MQ=255) cACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAg < 2:758074/150‑1 (MQ=255) | TGGATGAAAACATATTTCTCTGACTTCGGATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAG > NC_000913/3869038‑3869336 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |