| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3869187 | 128 (1.570) | 10 (0.130) | 8/262 | NT | 7.6% | coding (123/1248 nt) | yidR | DUF3748 domain‑containing galacturonate catabolism protein YidR |
| ? | NC_000913 | = 3869215 | 122 (1.570) | coding (95/1248 nt) | yidR | DUF3748 domain‑containing galacturonate catabolism protein YidR | |||||
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GATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGTGAT > NC_000913/3869066‑3869360 | gATGAACGGTCCCCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCTGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACAGCCTGTCgg > 2:1102258/1‑150 (MQ=255)gATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCgg > 2:1266041/1‑150 (MQ=255) aTGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGg > 1:655857‑M2/1‑149 (MQ=255) aTGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCGGGGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCGCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGg > 2:757108‑M2/1‑149 (MQ=255) aCGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtc < 1:1118412‑M2/150‑6 (MQ=255) cGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtcc > 2:979886‑M2/1‑144 (MQ=255) cGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtcc < 2:449905‑M2/150‑7 (MQ=255) cGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGgcgtcc < 1:1164732‑M2/150‑7 (MQ=255) 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aaaTACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATa > 1:1379671/1‑150 (MQ=255) aTACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGt > 2:1022250/1‑150 (MQ=255) aCCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACg > 1:28255/1‑56 (MQ=255) aCCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACg < 2:28255/56‑1 (MQ=255) ccAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCtt > 1:1351970/1‑150 (MQ=255) ccAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCtt > 1:610960/1‑150 (MQ=255) ccAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCtt < 2:152007/150‑1 (MQ=255) cACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCcatcat > 1:184669/1‑110 (MQ=255) ggCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCg > 2:1148121/1‑150 (MQ=255) cTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGtg > 2:983634/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGtgat < 2:307920/150‑1 (MQ=255) | GATGAACGGTCACCACGCCGACGTGTGCGCCCTGTGACGCGCGATAGATAACCTCGACCTCGCCGGTATGGATATTCACACGCTCAATGGTCTCGCCGGTAAACGACGCGCCAGAAGGACGCACGTCAAATACCAGCCACTGGCTGTCGGGCGTCCAGGTATTGGTATTGGTGAGCAGGTGATTACGGGGAGCAAAGGTTATCTGTTTCATGGCGCGGTCCTGATACAAAACGGGTCCCGCCATCATACTTCACAAGGACTTCACTTTCAGACAATAGTCTTTTGCCATCGTGAT > NC_000913/3869066‑3869360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |