| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 1079219 = | 77 (0.910) | intergenic (+73/‑86) | ymdG/putP | protein YmdG/proline:Na(+) symporter | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AAAAAAATAACTCAGACTTTTTCTCTGCGGCAGTTAACATTTTTGAAAGGTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTCCGGTGGCAGATATAACGGCAAGTTTCGACATTGCCGATAATAATTTTTTGGAGACTTTAGATGGCTATTAGCACACCGATGTTGG > NC_000913/1079036‑1079329 | aaaaaaaTAACTCAGACTTTTTCTCTGCGGCAGTTAACATTTTTGAAAGGTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATaa > 2:128495/1‑150 (MQ=255) tcaatatcatgccaaagatatagacacaaaatgtcaccaacatcggtgtgctaatagccatctaaagtctccaaaaaattattatcggcaatgtcgaaacttgccgttatatctgccaccggaacggggtaacagagtttatgttttAcc > 1:1151091‑M1/148‑150 (MQ=255) tcaatatcatgccaaagatatagacacaaaatgtcaccaacatcggtgtgataatagccatctaaagtctccaaaaaattattatcggcaatgtcgaaacttgccgttatatctgccaccggaacggggtaacagagtttatgttttAcc < 1:245448‑M1/3‑1 (MQ=255) 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AAAAAAATAACTCAGACTTTTTCTCTGCGGCAGTTAACATTTTTGAAAGGTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTCCGGTGGCAGATATAACGGCAAGTTTCGACATTGCCGATAATAATTTTTTGGAGACTTTAGATGGCTATTAGCACACCGATGTTGG > NC_000913/1079036‑1079329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |