| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1079185 = | 84 (0.960) | 5 (0.060) | 5/266 | NT | 6.0% | intergenic (+39/‑120) | ymdG/putP | protein YmdG/proline:Na(+) symporter |
| ? | NC_000913 | 1079219 = | 77 (0.910) | intergenic (+73/‑86) | ymdG/putP | protein YmdG/proline:Na(+) symporter | |||||
ACATTTTTGAAAGGTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTCCGGTGGCAGATATAACGGCAAGTTTCGACATTGCCGATAATAATTTTTTGGAGACTTTAGATGGCTATTAGCACACCGATGTTGGTGACATTTTGTGTCTATATCTTTGGCATGATATTGATTG > NC_000913/1079072‑1079368 | caccaacatcggtgtgctaatagccatctaaagtctccaaaaaattattatcggcaatgtcgaaacttgccgttatatctgccaccggaacggggtaacagagtttatgttttACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTaaa > 1:267355‑M1/114‑150 (MQ=255) cATTTTTGAAAGGTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTaaaa > 2:426211/1‑150 (MQ=255) accaacatcggtgtgctaatagccatctaaagtctccaaaaaattattatcggcaatgtcgaaacttgccgttatatctgccaccggaacggggtaacagagtttatgttttACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTaaaa > 2:1344884‑M1/113‑150 (MQ=255) tttttGAAAGGTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACa < 2:1216794/150‑1 (MQ=255) tttGAAAGGTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATa < 2:1363856/150‑1 (MQ=255) tttGAAAGGTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATa < 1:1421408/150‑1 (MQ=255) ggTGCAACAGCAAAAAATCTGAGAGACTGCAACATGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGATGTGTTAAATAGATTGTGAATAACCAGCGCTTACGGCAGCAAACGGTAGACCTGCTAAACCATaaaatata > 2:1482485/1‑145 (MQ=255) gtgctaatagccatctaaagtctccaaaaaattattatcggcaatgtcgaaacttgccgttatatctgccaccggaacggggtaacagagtttatgttttACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGt < 1:103544‑M1/50‑1 (MQ=255) gTGCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGt < 2:305849/150‑1 (MQ=255) agCAACCGCAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATAGTGTGTTAAATCGATTGTCAATAACCACCGATTCCTGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTCtt > 2:245448/2‑150 (MQ=255) cAAAAAATGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGtt > 2:353802/1‑150 (MQ=255) aaaaaTGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATGTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTcc < 1:41332/150‑1 (MQ=255) aaTGTGAGAGAGTGCAACCTGATGAAAAATAGTGTCGCTGAGCACTAAAATTTAATTTAAATGGTGTGTTAAATCGATTGTGAATAACCAGCGCTTCCGGCAGGATACGGTCTCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTCCGGt < 2:946704/150‑1 (MQ=255) 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aCGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTCCGGTGGCAGATATAACGGCAAGTTTCGACATTGCCGATAATAATTTTTTGGAGACTTTAGATGGCTATTAGCACACCGATGTTGGTGACATTTTGTGTCTATATCTTTgg < 1:1052262/150‑1 (MQ=255) ctttCGCCCTGTTAAAACATTAACTCTTTTACCCCGTTCCGGTGTCAGATATAACTTCAAGTTTCGACATTGCCGATAATAATTTTTTGGAGACTTTAGATTGCTATTAGCACACCGATGTTGTTGACATTTTGTGTCTATATCTTTGGc < 2:655967/147‑1 (MQ=255) cGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTCCGGTGGCAGATATAACGGCAAGTTTCGACATTGCCGATAATAATTTTTTGGAGACTTTAGATGGCTATTAGCACACCGATGTTGGTGACATTTTGTGTCTATATCTTTGGc > 2:468538/1‑150 (MQ=255) cGGTCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTCCGGTGGCAGATATAACGGCAAGTTTCGACATTGCCGATAATAATTTTTTGGAGACTTTAGATGGCTATTAGCACACCGATGTTGGTGACATTTTGTGTCTATATCTTTGGc < 1:1168479/150‑1 (MQ=255) tCGCCCTGGTAAAACATAAACTCTGTTACCCCGTTCCGGTGGCAGATATAACGGCAAGTTTCGACATTGCCGATAATAATTTTTTGGAGACTTTAGATGGCTATTAGCACACCGATGTTGGTGACATTTTGTGTCTATATCTTTGGCATg < 2:997818/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |