| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3046864 = | 90 (1.030) | 5 (0.060) | 5/268 | NT | 5.4% | coding (2178/2874 nt) | gcvP | glycine decarboxylase |
| ? | NC_000913 | 3046903 = | 88 (1.040) | coding (2139/2874 nt) | gcvP | glycine decarboxylase | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TCTGCGCCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACC > NC_000913/3046715‑3047011 | tccgtgaagtgtgtgaagtcgtgcatcagttcggcggtcaggtttaccttgatggcgcgaacatgaacgcccaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgc < 1:1284536‑M1/1‑1 (MQ=255)tCTGCGCCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTc < 1:41653/150‑1 (MQ=255) ccgtgaagtgtgtgaagtcgtgcatcagttcggcggtcaggtttaccttgatggcgcgaacatgaacgcccaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCa > 1:1046677‑M1/149‑150 (MQ=255) ccgtgaagtgtgggaagtcgtgcatcagttcggcggtcagggttaccttgatggcgcgaacatgaacgcgcaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCa > 2:1379228‑M1/149‑150 (MQ=255) tGCGCCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCAc < 1:370438/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTAATTTGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCAc > 2:133486/1‑150 (MQ=255) gtgaagtgtgtgaagtcgtgcatcagttcggcggtcaggtttaccttgatggcgcgaacatgaacgcccaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCACg > 1:1189499‑M1/147‑150 (MQ=255) gcgcCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACg > 2:1499459/1‑150 (MQ=255) gcgcCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACg > 2:78886/1‑150 (MQ=255) gcgcCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACg > 2:81759/1‑150 (MQ=255) gcCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGcc < 1:800495/150‑1 (MQ=255) ccATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGa > 2:659069/1‑150 (MQ=255) catcatGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGAt > 2:894899/1‑150 (MQ=255) tcatGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCg > 1:1172330/1‑150 (MQ=255) tGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTc > 2:45988/1‑150 (MQ=255) gCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTcc < 2:160144/150‑1 (MQ=255) tACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATAccc > 2:1199371/1‑150 (MQ=255) tACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTAACGAAAGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGAACAACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCAAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATAccc > 1:261102/1‑150 (MQ=255) 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tccttgatggctcgaacatgaacgcccaggttggcagcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCACGCCGATCG‑‑GTCGCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATg > 2:142966‑M1/105‑150 (MQ=255) gagGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATg > 1:1177722/1‑150 (MQ=255) ccttgatggcgcgaacatgaacgcccaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGc > 1:1165940‑M1/104‑150 (MQ=255) gcgcTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAg < 1:1177817/150‑1 (MQ=255) cgcTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGAGGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGa < 1:834573/150‑1 (MQ=255) tACCGAACGGTGCCGCAGCAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAg > 2:895588/1‑150 (MQ=255) tACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAg < 1:1247374/150‑1 (MQ=255) tACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAg < 1:1199371/150‑1 (MQ=255) gcgcgaacatgaacgcccaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCgg < 1:23281‑M1/42‑1 (MQ=255) gcgcgaacatgaacgcccaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCgg > 2:23281‑M1/96‑137 (MQ=255) 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tGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACCTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTgg > 1:1472022/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAgg < 1:933931/134‑1 (MQ=255) aCCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAgg > 2:933931/1‑134 (MQ=255) gTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCa < 1:45961/150‑1 (MQ=255) aCAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATg < 2:1319487/150‑1 (MQ=255) cAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATc < 2:210153/150‑1 (MQ=255) aaaTGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCa < 2:344858/150‑1 (MQ=255) aaaTGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCa > 2:854014/1‑150 (MQ=255) tGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAgg < 1:786439/150‑1 (MQ=255) tGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAgg < 2:329162/150‑1 (MQ=255) tGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAgg < 1:67462/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGGGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGt < 1:1499459/150‑1 (MQ=255) cgcTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTa < 1:396516/150‑1 (MQ=255) gcTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTCTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTaa < 1:78886/150‑1 (MQ=255) cTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTaaa < 1:659069/150‑1 (MQ=255) ttCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAAcc > 2:1464685/1‑150 (MQ=255) | TCTGCGCCCATCATGCGGATGTACATCCAGCTGATTGGCAGGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACC > NC_000913/3046715‑3047011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |