New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCACACACTTCACGGAT > NC_000913/3046755‑3047052 | ggATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCg < 2:834329/150‑1 (MQ=255) ggATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCg < 1:1322980/150‑1 (MQ=255) gATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCgg < 2:448832/150‑1 (MQ=255) tttaccttgatggcgcgaacatgaacgcccaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCACGGCGGTGGTGGTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCg > 1:1004957‑M1/108‑150 (MQ=255) tAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGaa < 1:133486/150‑1 (MQ=255) agagGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAAt > 2:1034887/1‑150 (MQ=255) tccttgatggctcgaacatgaacgcccaggttggcagcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCACGCCGATCG‑‑GTCGCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATg > 2:142966‑M1/105‑150 (MQ=255) gagGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATg > 2:1177817/1‑150 (MQ=255) gagGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATg > 1:1177722/1‑150 (MQ=255) ccttgatggcgcgaacatgaacgcccaggttggcatcacctcgccgggctttattggtgcggacgtttcacaccttaacctacataaaactttctgcattccgCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGc > 1:1165940‑M1/104‑150 (MQ=255) gcgcTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAg > 2:335721/1‑150 (MQ=255) cgcTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGAGGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGa < 1:834573/150‑1 (MQ=255) tACCGAACGGTGCCGCAGCAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAg > 2:895588/1‑150 (MQ=255) 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ccgcacggcggtggtggtccgggtatgggaccgatcggcgtgCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCgcgc < 1:23281‑M2/95‑1 (MQ=255) ccgcacggcggtggtggtccgggtatgggaccgatcggcgtgCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCgcgc > 2:23281‑M2/43‑137 (MQ=255) ACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGa < 2:726786‑M1/150‑1 (MQ=255) ACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGa < 2:933854‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGAc > 1:1149654‑M1/1‑150 (MQ=255) CGCCGATCG‑‑GTCCCATACACGGACCACCACCGCCGTGAGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAAAGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTCGGCGTTCATGTACGCGCCATCAAGGTAAACCTGAc < 2:789196‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGAccg < 2:1000486/150‑1 (MQ=255) cG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGaa < 1:620068/150‑1 (MQ=255) g‑‑gTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAAc > 2:1416856/1‑150 (MQ=255) g‑‑gTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAAc > 1:1516644/1‑150 (MQ=255) gTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACt > 1:790272/1‑150 (MQ=255) cccATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGa > 2:783090/1‑150 (MQ=255) cATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATg < 2:1532241/150‑1 (MQ=255) tACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCa > 2:954281/1‑150 (MQ=255) tACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCa < 1:1416856/150‑1 (MQ=255) aCCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCAc < 1:1077992/150‑1 (MQ=255) accaccaccGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTc < 1:45988/150‑1 (MQ=255) caccaccGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTcac < 1:971424/150‑1 (MQ=255) caccGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTcacaca > 1:115964/1‑150 (MQ=255) caccGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTcacaca < 1:264775/150‑1 (MQ=255) ccgccgTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCACACACt > 2:1072880/1‑150 (MQ=255) cgccgTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCACACACtt < 2:1516644/150‑1 (MQ=255) ccgTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCACACACTTCa < 1:1103007/150‑1 (MQ=255) cgtgCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCACACACTTCAc > 1:1189499‑M2/5‑150 (MQ=255) tgCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCACACACTTCACgg > 1:1046677‑M2/3‑150 (MQ=255) tgCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGCGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAACCCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCCCACACTTCACgg > 2:1379228‑M2/3‑150 (MQ=255) gCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCACACACTTCACGGa < 1:1284536‑M2/149‑1 (MQ=255) | GGATAGAGGCGCTACCGAACGGTGCCGCAGAAACCGCGCCCTGACGGGTTAACATGCCTTCGATTTGCACCACGCTATGACCCGGTACAAACGGTGCCAAATGCGCTTTCACGCCGATCG‑‑GTCCCATACCCGGACCACCACCGCCGTGCGGAATGCAGAAAGTTTTATGTAGGTTAAGGTGTGAAACGTCCGCACCAATAAAGCCCGGCGAGGTGATGCCAACCTGGGCGTTCATGTTCGCGCCATCAAGGTAAACCTGACCGCCGAACTGATGCACGACTTCACACACTTCACGGAT > NC_000913/3046755‑3047052 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |