| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3538406 | 66 (0.760) | 6 (0.070) | 6/262 | NT | 8.4% | coding (1022/2322 nt) | yhgF | putative RNA‑binding protein YhgF |
| ? | NC_000913 | = 3538453 | 69 (0.830) | coding (1069/2322 nt) | yhgF | putative RNA‑binding protein YhgF | |||||
GAAACCGAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCT > NC_000913/3538258‑3538554 | gAAACCGAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTaaaa > 2:769382/1‑150 (MQ=255) aaaCCGAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAg > 2:1062796/1‑150 (MQ=255) aaCCGAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGt < 2:271255/150‑1 (MQ=255) ccGAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTgg > 1:1050735/1‑150 (MQ=255) ccGAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTgg > 1:963945/1‑150 (MQ=255) ccGAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTgg > 1:155666/1‑150 (MQ=255) gAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCg > 2:1528920/1‑150 (MQ=255) gAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCg < 1:1336103/150‑1 (MQ=255) aaCTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCgg < 1:19236/150‑1 (MQ=255) aCTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCggt < 1:1062796/150‑1 (MQ=255) cTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCggtg > 2:1083012/1‑150 (MQ=255) gCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATg > 1:1145507/1‑150 (MQ=255) aCCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGcc < 1:769382/150‑1 (MQ=255) cgAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCaa > 1:140975/1‑150 (MQ=255) gAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCaaa < 1:1258333/150‑1 (MQ=255) tGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACtggt > 2:467659/1‑150 (MQ=255) gCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACtggtg < 2:520076/150‑1 (MQ=255) cGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACtggtgg < 2:217021/150‑1 (MQ=255) 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cAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttta < 1:253569‑M2/150‑5 (MQ=255) cAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCCGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttta < 2:951382‑M2/150‑5 (MQ=255) aaCGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttac < 2:1410183‑M2/150‑6 (MQ=255) gTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAtggtgtcggtcgccaccagtttgccagtggcatcgaccaccgccacttttacccc < 2:1391043‑M1/150‑56 (MQ=255) tCTTTGCCCGTACCCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAtggtgtcggtcgccaccagtttgccagtggcatcgaccaccgccacttttacccca < 1:1534187‑M1/150‑57 (MQ=255) 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tGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgcagggtacgggcaaaga < 1:1534187‑M2/150‑95 (MQ=255) ggggTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgcaggttacgggcaaagac < 2:1391043‑M2/150‑96 (MQ=255) ggggTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGt > 1:574396/1‑150 (MQ=255) gTAAAtggtgtcggtcgccaccagtttgccagtggcatcgaccaccgccacttttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgcaggttacgggcaaagacgtt < 2:1410183‑M1/150‑146 (MQ=255) tAAAtggtgtcggtcgccaccagtttgccagtggcatcgaccaccgccacttttaccccagtacgcagaccgggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgcaggttacgggcaaagacgttg < 2:951382‑M1/150‑147 (MQ=255) 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aatggtgtcggtcgccaccagtttgccagtggcatcgaccaccgccacttttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgcaggttacgggcaaagacgttgat < 1:605084‑M1/150‑149 (MQ=255) | GAAACCGAACTGATGGGCACCGTGCGCGAACGTGCGGAAGATGAAGCAATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCT > NC_000913/3538258‑3538554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |