| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3538406 | 66 (0.760) | 6 (0.070) | 6/262 | NT | 8.4% | coding (1022/2322 nt) | yhgF | putative RNA‑binding protein YhgF |
| ? | NC_000913 | = 3538453 | 69 (0.830) | coding (1069/2322 nt) | yhgF | putative RNA‑binding protein YhgF | |||||
ATCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAGAAGCAGTTCC > NC_000913/3538306‑3538600 | aTCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtt < 1:605084‑M2/150‑3 (MQ=255) tCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGTCGGTCGCCACCAgtt < 2:155666/150‑1 (MQ=255) tCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttt > 2:745845‑M2/1‑147 (MQ=255) tCAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttt < 1:529689‑M2/150‑4 (MQ=255) cAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttta < 1:253569‑M2/150‑5 (MQ=255) cAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttta < 1:134303‑M2/150‑5 (MQ=255) cAACGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCCGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAttta < 2:951382‑M2/150‑5 (MQ=255) aaCGTCTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttac < 2:1410183‑M2/150‑6 (MQ=255) cTTTGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCATGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGca > 2:237510/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGcac > 1:1264591/1‑150 (MQ=255) tGCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCacac > 1:804414/1‑150 (MQ=255) gCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACAcc > 1:39372/1‑150 (MQ=255) gCCCGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACAcc > 1:828129/1‑150 (MQ=255) ccGTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCgg < 1:29098/150‑1 (MQ=255) gTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGAc > 2:884299/1‑150 (MQ=255) gTAACCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGAc < 2:1534684/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGCCCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAg > 2:589952/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGGCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGc < 2:119931/150‑1 (MQ=255) tGCACGATCTGCTGAGGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCg < 2:1275276/150‑1 (MQ=255) gCACGATCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGc > 1:444366/1‑150 (MQ=255) tCTGCTGATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAagc < 2:1264591/150‑1 (MQ=255) tgctgATGGCGGACCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAagcag > 2:1239975/1‑150 (MQ=255) gctgATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAagcagc < 2:608119/150‑1 (MQ=255) tgATGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGa > 2:604340/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGa > 2:1261073/1‑150 (MQ=255) ggcgacCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGAc > 1:1411636/1‑150 (MQ=255) gcggcCCCTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGCCCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGAcc > 1:1251156/1‑150 (MQ=255) gcCCCTGACGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGtt > 2:422233/1‑150 (MQ=255) cccTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTtgc > 1:468984/1‑150 (MQ=255) cccTGCCGGACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTtgc > 1:594646/1‑150 (MQ=255) gACTGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCtgt < 1:694387/150‑1 (MQ=255) tGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCtgtgtg < 2:605084/150‑1 (MQ=255) tGCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCtgtgtg < 2:134303/150‑1 (MQ=255) gCGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGa > 2:1538525/1‑150 (MQ=255) cGTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGaa > 2:83430/1‑150 (MQ=255) gTGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGaaa > 1:1181043/1‑150 (MQ=255) tGCAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGaaaa > 2:795248/1‑150 (MQ=255) cAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAAc < 2:468984/150‑1 (MQ=255) cAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAAc > 1:869317/1‑150 (MQ=255) cAACGATGGGCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAAc < 1:1239975/150‑1 (MQ=255) aaCGATGGGCCGCGATCCGGCTCCGCGTACTGGCGTAAAACTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGGCGCGACCGACACCAGTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAACAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGCGTGAAAAACa < 2:1454760/150‑1 (MQ=255) aggggCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAAc < 2:975922/148‑1 (MQ=255) gggCCTCGATCCGGGTCTGCGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGt < 1:604340/150‑1 (MQ=255) 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cGTACTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGt < 1:1410183/150‑1 (MQ=255) aCTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgca < 2:1427444‑M2/137‑80 (MQ=255) aCTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgca > 1:1427444‑M2/1‑58 (MQ=255) aCTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAAc < 2:529689/150‑1 (MQ=255) cTGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgcaggttacgggcaaag < 2:67890‑M2/150‑94 (MQ=255) tGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCTAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACgg > 2:690375/1‑150 (MQ=255) tGGGGTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgcagggtacgggcaaaga < 1:1534187‑M2/150‑95 (MQ=255) ggggTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCAtttaccccagtacgcagacccggatcgaggcccatcgttgcacgcagtccggcaggggccgccatcagcagatcgtgcaggttacgggcaaagac < 2:1391043‑M2/150‑96 (MQ=255) ggggTAAAAGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGt > 1:574396/1‑150 (MQ=255) aaaaGTGGCGGTGGTCGATGCCACTGGCAAACTGGTGGCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGc > 2:394453/1‑150 (MQ=255) 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gtggCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGAtgtg > 1:906680/1‑150 (MQ=255) ggCGAGCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCa < 1:155220/150‑1 (MQ=255) ggCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCa < 2:963945/150‑1 (MQ=255) ggCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCa > 2:1389017/1‑150 (MQ=255) gCGACCGACACCATTTACCCGCACACCGGACAGGCCGCAAAAGCAGCGATGACCGTTGCTGCGCTGTGTGAAAAACATAACGTTGAACTGGTAGCGATCGGTAACGGTACAGCTTCCCGCGAAACTGAGCGTTTCTATCTCGATGTGCAg < 1:422233/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |