| New junction evidence | |||||||||||
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GCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGT > NC_000913/3546637‑3546934 | gCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA < 1:592399‑M1/150‑1 (MQ=255) ctctCGTCCTCGGGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAg < 1:1376803/150‑1 (MQ=255) ctcGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAc > 2:10100/1‑150 (MQ=255) 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aaTGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGcc > 1:427292/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATtgccagcattttgcccagcattgcgccaaaacccatgatcagggcaaggctaccgagcgtcccgccgtcaccggctttgatggagccaataactttatccagcg < 2:1070868‑M2/150‑105 (MQ=255) tGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTgg < 1:10100/150‑1 (MQ=255) tGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTgg < 2:440043/150‑1 (MQ=255) ggCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATtgccagcattttgcccagcattgcgccaaaacccatgatcagggcaaggctaccgagcgtcccgccgaccccggcgttgatggagccaagaactttatgcagcggcat < 1:436188‑M2/150‑109 (MQ=255) ggCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAACCACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGgt > 1:1468536/1‑150 (MQ=255) cAatcagcgtggtggcgatacgttgtgcgccaccgcagtctgccagcattttgcccagcattgcgccaaaacccatgatcagggcaaggctaccgagcgtcccgccgacaccggctttgatggagccaataactttatccagcggcattc > 1:148341‑M1/1‑2 (MQ=255) cAatcagcgtggtggcgatacgttgtgcgccaccgcagtctgccagcattttgcccagcattgcgccaaaacccatgatcagggcaaggctaccgagcgtcccgccgacaccggctttgatggagccaataactttatccagcggcattc > 1:131899‑M1/1‑2 (MQ=255) | GCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGT > NC_000913/3546637‑3546934 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |