New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3546786 | 77 (0.880) | 5 (0.060) | 5/266 | NT | 6.0% | coding (228/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter |
? | NC_000913 | = 3546824 | 83 (0.990) | coding (266/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter |
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTAT > NC_000913/3546675‑3546972 | aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGAt > 1:595421/1‑150 (MQ=255) gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATtg > 1:131899‑M2/1‑148 (MQ=255) gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATtg > 1:148341‑M2/1‑148 (MQ=255) 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2:287734/149‑1 (MQ=255) ggCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTTGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTTGTTTTGCCCTGTTCTATGAATTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGGTTACCATcgcg < 2:1504898/150‑1 (MQ=255) ggCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATcgcg > 2:1396879/1‑150 (MQ=255) gcgcACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCgg < 1:812516/150‑1 (MQ=255) acaACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTc < 2:226511/150‑1 (MQ=255) caACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCt > 2:1029221/1‑150 (MQ=255) cGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCg < 1:64294/150‑1 (MQ=255) cGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAatat > 1:1257651/1‑150 (MQ=255) caccacGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACGCATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTcc > 2:834284/1‑150 (MQ=255) caccacGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTcc < 2:371704/150‑1 (MQ=255) ccacGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGGTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCAc < 1:505873/150‑1 (MQ=255) cacGCTGATtgccagcattttgcccagcattgcgccaaaacccatgatcagggcaaggctaccgagcgtcccgccgtcaccggctttgatggagccaataactttatccagcggcattccttgcattaatccaacagcaagcgccacgag > 1:1070868‑M2/1‑9 (MQ=255) cacGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCAct > 2:1482455/1‑150 (MQ=255) acGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCActg < 1:562898/150‑1 (MQ=255) cTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCActgctg < 2:472353/150‑1 (MQ=255) tGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGt < 2:704231/150‑1 (MQ=255) gATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCCGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTa < 2:773822/150‑1 (MQ=255) aTTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTAt < 1:1102319/150‑1 (MQ=255) | AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTAT > NC_000913/3546675‑3546972 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |