New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1201870 = | 68 (0.780) | 4 (0.050) | 4/264 | NT | 5.8% | coding (215/309 nt) | ymfJ | e14 prophage; protein YmfJ |
? | NC_000913 | 1201905 = | 65 (0.780) | coding (180/309 nt) | ymfJ | e14 prophage; protein YmfJ |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGCAACAATGC > NC_000913/1201757‑1202054 | cTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTg > 1:400514‑M2/1‑149 (MQ=255) cTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTg < 2:622241‑M2/150‑2 (MQ=255) cTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTg > 2:88499‑M2/1‑149 (MQ=255) 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tgcaggcactgaggcccgcattttgttagcaaaacaggcattaaagacttgcggggcgcaagcccctggtcgaaccgagttcatgaatttcatggctaacacaCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCAt > 1:783679‑M1/104‑150 (MQ=255) tCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAAtt > 2:1075117/1‑150 (MQ=255) ccTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTc < 1:184967/150‑1 (MQ=255) ccTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTAACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAAtta > 1:399897/1‑149 (MQ=255) cTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCa < 1:529229/150‑1 (MQ=255) 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ctcCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAAc < 1:108342/150‑1 (MQ=255) ctcCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAAc > 2:489859/1‑150 (MQ=255) cATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCATGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGtt > 2:1198140/1‑150 (MQ=255) aTTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGttt < 2:961840/150‑1 (MQ=255) tGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAg > 2:1419618/1‑150 (MQ=255) gCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGc > 1:697024/1‑150 (MQ=255) cATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACGAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCg < 2:276756/150‑1 (MQ=255) agagGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTcc < 1:305304/150‑1 (MQ=255) agagGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTcc > 2:1458224/1‑150 (MQ=255) gagGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGGTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCa < 1:413300/150‑1 (MQ=255) agGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAg < 1:489859/150‑1 (MQ=255) ggggTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGc < 1:758334/150‑1 (MQ=255) ggtgagTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGcaa < 1:969057‑M2/144‑1 (MQ=255) ggtgagTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGcaa > 2:1287910‑M2/7‑150 (MQ=255) ggtgagTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGcaa > 2:358708‑M2/7‑150 (MQ=255) gagTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGca > 1:772964‑M2/4‑146 (MQ=255) gagTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGca < 2:772964‑M2/143‑1 (MQ=255) agTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGCAACAAt > 2:1420624‑M2/3‑150 (MQ=255) tgtgtTAGCCATGTAATTAATGAACTCGGTTCTACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGCAACAATGc < 1:1428611/150‑1 (MQ=255) tgtgtTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGCAACAATGc < 2:155240/150‑1 (MQ=255) | CTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGATTTCGTTCATTACGATCTTACGCCTAAGCCCATCAAGCTCGATTCTTAAAGCCTTAACCATTGTGTCGTGATAAACACGGCTCACCTTCTCTCCATTGCATGGCAGAGGGGTGAGTGTGTTAGCCATGAAATTCATGAACTCGGTTCGACCAGGGGCTTGCGCCCCGCAAGTCTTTAATGCCTGTTTTGCTAACAAAATGCGGGCCTCAGTGCCTGCATTTGGCTCTATCTGCTGCAAACGTTTAGCGTCTTCCAGCAACAATGC > NC_000913/1201757‑1202054 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |