| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 884930 | 98 (1.140) | intergenic (+25/+16) | mdfA/ybjH | multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter/uncharacterized protein YbjH | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCGGTAAGCCGGAGCTGGCGCAGGAGCCACATAGACGG > NC_000913/884768‑885064 | aaaTCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAc > 2:343169/1‑150 (MQ=255) tCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGTGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGc > 1:694930/1‑150 (MQ=255) gCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCttt < 2:517951/150‑1 (MQ=255) 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aaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCGGTAAGCCGGAGCTGGCGCAGGAGCcaca < 1:504375/150‑1 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccgttgacaaggttgaagagattaaacagtccgttgcccccgttca > 1:709373‑M2/1‑22 (MQ=255) tGCCTGAtcgctcaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccgttgacaaggttgaagagattaaacagtccgttgcccccgttcagc < 1:35116‑M1/150‑144 (MQ=255) tGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccgttgacaaggttgaagagattaaacagtccgttgcccccgttcagc < 1:664538‑M1/150‑144 (MQ=255) ccTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccgttgacaaggttgaagagattaaacagtccgttgcccccgttcagcca > 1:1101797‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccgttgacaaggttgaagagattaaacagtccgttgcccccgttcagcca > 2:1424435‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTGACTGCTTTGTGCGAtcagacatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattc > 1:300482‑M2/1‑18 (MQ=255) ccTGACTGCTTTGTGCGAtcagacatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattc < 2:300482‑M2/101‑84 (MQ=255) ccTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCGGTAAGCCGGAGCTGGCGCAGGAGCCACATAGAc < 2:664538/150‑1 (MQ=255) tGACTGCTTTGTGCGATCATGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCGGTAAGCCGGAGCTGGCGCAGGAGCCACATAGACgg < 2:1281901/150‑1 (MQ=255) tGAATGCTTAGTGCGATCAGCCATTCTCGAATTAATGGTAATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATACCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCGGTAAGCCGGAGCTGGCGCAGGAGCCACATAGACgg > 2:1154416/1‑150 (MQ=255) | GAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCGGTAAGCCGGAGCTGGCGCAGGAGCCACATAGACGG > NC_000913/884768‑885064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |