| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 884917 | 97 (1.050) | 10 (0.120) | 8/258 | NT | 9.6% | intergenic (+12/+29) | mdfA/ybjH | multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter/uncharacterized protein YbjH |
| ? | NC_000913 | = 884930 | 98 (1.140) | intergenic (+25/+16) | mdfA/ybjH | multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter/uncharacterized protein YbjH | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCGGTAAGCCGGAGCTGGCGCAGGAGCCACATAGACGGTTTGCGGCACAGTC > NC_000913/884786‑885078 | tGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcagg > 1:1101797‑M2/1‑145 (MQ=255) ggCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggc < 1:1555633‑M2/150‑7 (MQ=255) gCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggca < 1:664538‑M2/150‑8 (MQ=255) gCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGAGCGAtcaggca < 1:35116‑M2/150‑8 (MQ=255) aCGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtctc > 1:938855/1‑150 (MQ=255) cGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCg > 2:523318/1‑150 (MQ=255) ggggCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGaa > 2:478214/1‑150 (MQ=255) gtgCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTTTCAACGTAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGT‑AAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAt < 2:566193/148‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |