New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 647732 | 73 (0.790) | 4 (0.040) | 4/270 | NT | 5.2% | coding (304/552 nt) | citX | apo‑citrate lyase phosphoribosyl‑dephospho‑CoA transferase |
? | NC_000913 | = 647767 | 75 (0.830) | coding (269/552 nt) | citX | apo‑citrate lyase phosphoribosyl‑dephospho‑CoA transferase |
GTGAATAGTCGCGGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCACGCAAGGCTGTCACGCCATGATTAAAAATTCGGCGTGTGACCTCGCTGTCTTTAATCGGCCCAGGCGCAACCACGGTAAAGGAG > NC_000913/647618‑647913 | gTGAATAGTCGCGGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGcc < 1:830262/150‑1 (MQ=255) tGAATAGTCGCGGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCc > 1:1323070‑M2/1‑149 (MQ=255) gAATAGTCGCGGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCcg > 2:40093‑M2/1‑148 (MQ=255) tAGTCGCGGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTg > 1:1350516/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCGGGAGATATTTTGGCCTTCGGGCGTGAGGACATCGATATCCGATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATTCCCTCCGGCCCGCTGGCg < 1:1004083/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCTAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCgg < 1:266985/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCgg < 1:91284/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCgg > 1:1310855/1‑150 (MQ=255) gcggcgGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGa < 2:494066/150‑1 (MQ=255) ggAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGTCCGCTGGCGGAAACCAg < 2:757476/150‑1 (MQ=255) gagagaATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGt < 1:475910/150‑1 (MQ=255) gagaATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATGGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGc > 1:185822/1‑150 (MQ=255) aaTTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGc < 2:1309142/150‑1 (MQ=255) aTTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGcc > 1:552803/1‑150 (MQ=255) aTTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGcc > 1:1288156/1‑150 (MQ=255) aTTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGcc < 1:236431/150‑1 (MQ=255) ccTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTcc > 2:1223155/1‑150 (MQ=255) ccTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTcc < 1:1492855/150‑1 (MQ=255) ttagagCGTCAGGACATCAATAACACATAAACCCACTAGATGAAGAATATCTTCAAGAACAAAAATAAAAAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTg > 2:561623/6‑150 (MQ=255) cGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTg < 2:216939/150‑1 (MQ=255) tCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGcc < 1:659939/150‑1 (MQ=255) tCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGcc > 1:432262/1‑150 (MQ=255) aGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAg < 2:1367970/150‑1 (MQ=255) 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tCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCg < 1:1377110/150‑1 (MQ=255) cccATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCgg > 1:1597535/1‑150 (MQ=255) caaaaCCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCt > 2:638766/4‑150 (MQ=255) aTAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTa < 1:313185/150‑1 (MQ=255) aaCCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAg < 2:50451/150‑1 (MQ=255) cGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCa < 2:236158/150‑1 (MQ=255) cccGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCACg < 2:6845/150‑1 (MQ=255) ccGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCACGc < 2:1128997/150‑1 (MQ=255) cGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCACGCa > 2:1109879/1‑150 (MQ=255) agGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCACGCAAGGc < 1:389305/150‑1 (MQ=255) 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ggCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCACGCAAGGCTGTCACGCCATGATTAAAAATTCGGCGTGTGACCTCGCTGTCTTTAATCGGCCCAGGCGCAACCACGGTAAAg < 1:878298/147‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCACGCAAGGCTGTCACGCCATGATTAAAAATTCGGCGTGTGACCTCGCTGTCTTTAATCGGCCCAGGCGCAACCACGGTAAAGgag < 1:631334/150‑1 (MQ=255) | GTGAATAGTCGCGGCGGGAGAGAATTTCGCCTTCGGGCGTCAGGACATCGATATCCCATAACCGCCCGAGAGGATGACTATGTTCAAGCTCAATGGTGGCGAGCTTGAGGTCGCGAGCCGGGGCGGCAATGCTCAACATGCCCTCCGGCCCGCTGGCGGAAACCAGTGCAGCCTGCTCCTGAATTTGCCAGCCCTGTTTTGCGGCTAAGGCACGCAAGGCTGTCACGCCATGATTAAAAATTCGGCGTGTGACCTCGCTGTCTTTAATCGGCCCAGGCGCAACCACGGTAAAGGAG > NC_000913/647618‑647913 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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