New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 1909080 = | 81 (0.920) | coding (156/240 nt) | yobH | protein YobH |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAATATA > NC_000913/1908932‑1909229 | gtgagaatctggttatttattgcccttaaccattatcgaccacgatattgcttttgcgtaacagcgggcaatctgttatccccaaaaaaccacttttagtgtgcaagtatTGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAAt > 1:245973‑M1/111‑150 (MQ=255) tgagaatctggttatttattgcccttaaccattatcgaccacgatattgcttttgcgtaacagcgggcaatctgttatccccaaaaaaccacttttagtgtgcaagtatTGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATa > 2:913305‑M1/110‑150 (MQ=255) gagaatcttgttatttattgcccttaacaattatcgaccacgatattgcttttgcgtaacagcgggcaatctgttatccccaaaaaaccacttttagtgtgcaagtatTGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAAtag > 1:550073‑M1/109‑149 (MQ=255) tcatTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACt < 2:1152526/150‑1 (MQ=255) gaatctggttatttattgcccttaaccattatcgaccacgatattgcttttgcgtaacagagggcaatctgttatccccaaaaatccacttttagtgtgcaagtatTGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACtt > 2:1464739‑M1/107‑150 (MQ=255) gaatctggttatttattgcccttaaccattatcgaccacgatattgcttttgcgtaacagagggcaatctgttatccccaaaaaaccacttttagtgttcaagtatTGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACtt > 2:1458842‑M1/107‑150 (MQ=255) atTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTg < 2:814394/150‑1 (MQ=255) cGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGcac > 2:964491/1‑150 (MQ=255) cacaGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCacac < 2:126491/150‑1 (MQ=255) tGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACATATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTg < 1:1071856/150‑1 (MQ=255) gCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTgg > 2:142770/1‑150 (MQ=255) gCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTgg > 1:270305/1‑150 (MQ=255) cTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTAACTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGtcga > 1:1021588/1‑147 (MQ=255) 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ccAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGTGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAg > 2:390195/1‑150 (MQ=255) ccAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAg > 2:397025/1‑150 (MQ=255) cAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAga > 1:764965/1‑149 (MQ=255) aGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAgcg < 1:397025/150‑1 (MQ=255) gCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGATGTTACGCAAAAGAAATATCGTGGTCGATAATGGTTAGGGGCAATAAATAACCAGATACTCACTCCAGAGTAAAATACTCTTATAGCAAgcgc > 2:1551789/1‑150 (MQ=255) acaATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAat > 2:761661‑M2/4‑150 (MQ=255) acaATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAat > 2:327308‑M2/4‑150 (MQ=255) caATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAata > 2:171273‑M2/3‑150 (MQ=255) caATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAata > 2:165437‑M2/3‑150 (MQ=255) aTACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAAtata > 1:437294/1‑150 (MQ=255) | TCATCATTCGCACAGTTATGCTGATAGCACTGGTATGGATAGGATTATTACTCAGCGGATATGGCGTTTTGATTGGAAGCAAAGAGAATGCCGCAGGATTAGGTTTGCAATGTACCTATCTGACTGCCAGAGGCACCAGCACGGTACAATACTTGCACACTAAAAGTGGTTTTTTGGGGATAACAGATTGCCCGCTGTTACGCAAAAGCAATATCGTGGTCGATAATGGTTAAGGGCAATAAATAACCAGATTCTCACTCCTGAGTAAAATACTCTTATAGCAAGCGCGTTTAATATA > NC_000913/1908932‑1909229 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |